| Home » date » 2007 » Dec » 17 » attachments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cluster 50+ vs transportmiddelenproductie3r49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| R Software Module: rwasp_hierarchicalclustering.wasp (opens new window with default values) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Title produced by software: Hierarchical Clustering | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Date of computation: Mon, 17 Dec 2007 03:43:05 -0700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cite this page as follows: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Statistical Computations at FreeStatistics.org, Office for Research Development and Education, URL http://www.freestatistics.org/blog/date/2007/Dec/17/t1197887355vw338f11d0lcmnh.htm/, Retrieved Mon, 17 Dec 2007 11:29:15 +0100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| User-defined keywords: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dataseries X: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| » Textbox « » Textfile « » CSV « | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 88900 124,9 87280 132 85519 151,4 83647 108,9 81616 121,3 80100 123,4 94027 90,3 102327 79,3 104296 117,2 101593 116,9 94816 120,8 93535 96,1 93618 100,8 92330 105,3 90751 116,1 88576 112,8 86102 114,5 85494 117,2 103432 77,1 108870 80,1 109713 120,3 106960 133,4 103195 109,4 102348 93,2 102158 91,2 100431 99,2 97649 108,2 95611 101,5 93035 106,9 93579 104,4 111777 77,9 116065 60 116609 99,5 112934 95 107660 105,6 107965 102,5 107772 93,3 106201 97,3 102288 127 99217 111,7 96511 96,4 96456 133 113021 72,2 117836 95,8 118492 124,1 113922 127,6 109317 110,7 107496 104,6 105524 112,7 103824 115,3 101833 139,4 99436 119 96915 97,4 96072 154 111941 81,5 116008 88,8 117557 127,7 113445 105,1 108762 114,9 106661 106,4 102824 104,5 101912 121,6 99005 141,4 97894 99 96256 126,7 95606 134,1 108948 81,3 111223 88,6 113142 132,7 106078 132,9 100992 134,4 97413 103,7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Text written by user: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Output produced by software: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Charts produced by software: |
| Parameters (Session): | par1 = ward ; par2 = ALL ; par3 = FALSE ; par4 = FALSE ; | | Parameters (R input): | par1 = ward ; par2 = ALL ; par3 = FALSE ; par4 = FALSE ; | | R code (references can be found in the software module): | par3 <- as.logical(par3)
| par4 <- as.logical(par4) if (par3 == 'TRUE'){ dum = xlab xlab = ylab ylab = dum } x <- t(y) hc <- hclust(dist(x),method=par1) d <- as.dendrogram(hc) str(d) mysub <- paste('Method: ',par1) bitmap(file='test1.png') if (par4 == 'TRUE'){ plot(d,main=main,ylab=ylab,xlab=xlab,horiz=par3, nodePar=list(pch = c(1,NA), cex=0.8, lab.cex = 0.8),type='t',center=T, sub=mysub) } else { plot(d,main=main,ylab=ylab,xlab=xlab,horiz=par3, nodePar=list(pch = c(1,NA), cex=0.8, lab.cex = 0.8), sub=mysub) } dev.off() if (par2 != 'ALL'){ if (par3 == 'TRUE'){ ylab = 'cluster' } else { xlab = 'cluster' } par2 <- as.numeric(par2) memb <- cutree(hc, k = par2) cent <- NULL for(k in 1:par2){ cent <- rbind(cent, colMeans(x[memb == k, , drop = FALSE])) } hc1 <- hclust(dist(cent),method=par1, members = table(memb)) de <- as.dendrogram(hc1) bitmap(file='test2.png') if (par4 == 'TRUE'){ plot(de,main=main,ylab=ylab,xlab=xlab,horiz=par3, nodePar=list(pch = c(1,NA), cex=0.8, lab.cex = 0.8),type='t',center=T, sub=mysub) } else { plot(de,main=main,ylab=ylab,xlab=xlab,horiz=par3, nodePar=list(pch = c(1,NA), cex=0.8, lab.cex = 0.8), sub=mysub) } dev.off() str(de) } load(file='createtable') a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Summary of Dendrogram',2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Label',header=TRUE) a<-table.element(a,'Height',header=TRUE) a<-table.row.end(a) num <- length(x[,1])-1 for (i in 1:num) { a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,hc$labels[i]) a<-table.element(a,hc$height[i]) a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file='mytable1.tab') if (par2 != 'ALL'){ a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Summary of Cut Dendrogram',2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Label',header=TRUE) a<-table.element(a,'Height',header=TRUE) a<-table.row.end(a) num <- par2-1 for (i in 1:num) { a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,i) a<-table.element(a,hc1$height[i]) a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file='mytable2.tab') } | Copyright
Software written by Ed van Stee & Patrick Wessa Disclaimer Information provided on this web site is provided "AS IS" without warranty of any kind, either express or implied, including, without limitation, warranties of merchantability, fitness for a particular purpose, and noninfringement. We use reasonable efforts to include accurate and timely information and periodically update the information, and software without notice. However, we make no warranties or representations as to the accuracy or completeness of such information (or software), and we assume no liability or responsibility for errors or omissions in the content of this web site, or any software bugs in online applications. Your use of this web site is AT YOUR OWN RISK. Under no circumstances and under no legal theory shall we be liable to you or any other person for any direct, indirect, special, incidental, exemplary, or consequential damages arising from your access to, or use of, this web site. Privacy Policy We may request personal information to be submitted to our servers in order to be able to:
We NEVER allow other companies to directly offer registered users information about their products and services. Banner references and hyperlinks of third parties NEVER contain any personal data of the visitor. We do NOT sell, nor transmit by any means, personal information, nor statistical data series uploaded by you to third parties.
We store a unique ANONYMOUS USER ID in the form of a small 'Cookie' on your computer. This allows us to track your progress when using this website which is necessary to create state-dependent features. The cookie is used for NO OTHER PURPOSE. At any time you may opt to disallow cookies from this website - this will not affect other features of this website. We examine cookies that are used by third-parties (banner and online ads) very closely: abuse from third-parties automatically results in termination of the advertising contract without refund. We have very good reason to believe that the cookies that are produced by third parties (banner ads) do NOT cause any privacy or security risk. FreeStatistics.org is safe. There is no need to download any software to use the applications and services contained in this website. Hence, your system's security is not compromised by their use, and your personal data - other than data you submit in the account application form, and the user-agent information that is transmitted by your browser - is never transmitted to our servers. As a general rule, we do not log on-line behavior of individuals (other than normal logging of webserver 'hits'). However, in cases of abuse, hacking, unauthorized access, Denial of Service attacks, illegal copying, hotlinking, non-compliance with international webstandards (such as robots.txt), or any other harmful behavior, our system engineers are empowered to log, track, identify, publish, and ban misbehaving individuals - even if this leads to ban entire blocks of IP addresses, or disclosing user's identity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||