R version 2.8.0 (2008-10-20) Copyright (C) 2008 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. Natural language support but running in an English locale R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(23 + ,10 + ,53 + ,7 + ,12 + ,2 + ,4 + ,0 + ,0 + ,21 + ,6 + ,86 + ,4 + ,11 + ,4 + ,3 + ,0 + ,0 + ,21 + ,13 + ,66 + ,6 + ,14 + ,7 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,12 + ,67 + ,5 + ,12 + ,3 + ,3 + ,0 + ,1 + ,24 + ,8 + ,76 + ,4 + ,21 + ,7 + ,6 + ,0 + ,0 + ,22 + ,6 + ,78 + ,3 + ,12 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,10 + ,53 + ,5 + ,22 + ,7 + ,6 + ,0 + ,0 + ,22 + ,10 + ,80 + ,6 + ,11 + ,2 + ,6 + ,0 + ,0 + ,21 + ,9 + ,74 + ,5 + ,10 + ,1 + ,5 + ,0 + ,0 + ,20 + ,9 + ,76 + ,6 + ,13 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,22 + ,7 + ,79 + ,7 + ,10 + ,6 + ,3 + ,0 + ,1 + ,21 + ,5 + ,54 + ,6 + ,8 + ,1 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,14 + ,67 + ,7 + ,15 + ,1 + ,7 + ,0 + ,1 + ,23 + ,6 + ,87 + ,6 + ,10 + ,1 + ,5 + ,0 + ,0 + ,22 + ,10 + ,58 + ,4 + ,14 + ,2 + ,5 + ,0 + ,1 + ,23 + ,10 + ,75 + ,6 + ,14 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,22 + ,7 + ,88 + ,4 + ,11 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,24 + ,10 + ,64 + ,5 + ,10 + ,1 + ,6 + ,0 + ,1 + ,23 + ,8 + ,57 + ,3 + ,13 + ,7 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,6 + ,66 + ,3 + ,7 + ,1 + ,2 + ,0 + ,1 + ,23 + ,10 + ,54 + ,4 + ,12 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,23 + ,12 + ,56 + ,5 + ,14 + ,4 + ,4 + ,0 + ,0 + ,21 + ,7 + ,86 + ,3 + ,11 + ,2 + ,6 + ,0 + ,1 + ,20 + ,15 + ,80 + ,7 + ,9 + ,1 + ,3 + ,0 + ,0 + ,32 + ,8 + ,76 + ,7 + ,11 + ,1 + ,5 + ,0 + ,1 + ,22 + ,10 + ,69 + ,4 + ,15 + ,5 + ,4 + ,0 + ,0 + ,21 + ,13 + ,67 + ,4 + ,13 + ,2 + ,5 + ,0 + ,1 + ,21 + ,8 + ,80 + ,5 + ,9 + ,1 + ,2 + ,0 + ,0 + ,21 + ,11 + ,54 + ,6 + ,15 + ,3 + ,2 + ,0 + ,1 + ,22 + ,7 + ,71 + ,5 + ,10 + ,1 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,9 + ,84 + ,4 + ,11 + ,2 + ,2 + ,0 + ,0 + ,21 + ,10 + ,74 + ,6 + ,13 + ,5 + ,2 + ,0 + ,1 + ,21 + ,8 + ,71 + ,5 + ,8 + ,2 + ,2 + ,0 + ,1 + ,22 + ,15 + ,63 + ,5 + ,20 + ,6 + ,5 + ,0 + ,1 + ,21 + ,9 + ,71 + ,6 + ,12 + ,4 + ,5 + ,0 + ,1 + ,21 + ,7 + ,76 + ,2 + ,10 + ,1 + ,1 + ,0 + ,0 + ,21 + ,11 + ,69 + ,6 + ,10 + ,3 + ,5 + ,0 + ,1 + ,21 + ,9 + ,74 + ,7 + ,9 + ,6 + ,2 + ,0 + ,1 + ,23 + ,8 + ,75 + ,5 + ,14 + ,7 + ,6 + ,0 + ,0 + ,21 + ,8 + ,54 + ,5 + ,8 + ,4 + ,1 + ,0 + ,1 + ,23 + ,12 + ,69 + ,5 + ,11 + ,5 + ,3 + ,0 + ,0 + ,23 + ,13 + ,68 + ,6 + ,13 + ,3 + ,2 + ,0 + ,0 + ,21 + ,9 + ,75 + ,4 + ,11 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,11 + ,75 + ,6 + ,11 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,20 + ,8 + ,72 + ,5 + ,10 + ,2 + ,4 + ,0 + ,0 + ,21 + ,10 + ,67 + ,5 + ,14 + ,2 + ,3 + ,0 + ,1 + ,21 + ,13 + ,63 + ,3 + ,18 + ,1 + ,6 + ,0 + ,1 + ,22 + ,12 + ,62 + ,4 + ,14 + ,2 + ,4 + ,0 + ,0 + ,21 + ,12 + ,63 + ,4 + ,11 + ,1 + ,5 + ,0 + ,1 + ,21 + ,9 + ,76 + ,2 + ,12 + ,2 + ,2 + ,0 + ,0 + ,22 + ,8 + ,74 + ,3 + ,13 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,20 + ,9 + ,67 + ,6 + ,9 + ,5 + ,5 + ,0 + ,0 + ,22 + ,12 + ,73 + ,5 + ,10 + ,5 + ,3 + ,0 + ,1 + ,22 + ,12 + ,70 + ,6 + ,15 + ,2 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,16 + ,53 + ,2 + ,20 + ,1 + ,7 + ,0 + ,1 + ,23 + ,11 + ,77 + ,3 + ,12 + ,1 + ,4 + ,0 + ,1 + ,22 + ,13 + ,77 + ,6 + ,12 + ,2 + ,2 + ,0 + ,0 + ,24 + ,10 + ,52 + ,3 + ,14 + ,3 + ,3 + ,0 + ,0 + ,23 + ,9 + ,54 + ,6 + ,13 + ,7 + ,6 + ,0 + ,0 + ,21 + ,14 + ,80 + ,6 + ,11 + ,4 + ,7 + ,1 + ,1 + ,22 + ,13 + ,66 + ,4 + ,17 + ,4 + ,4 + ,1 + ,0 + ,22 + ,12 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+ ,6 + ,6 + ,1 + ,0 + ,22 + ,10 + ,38 + ,6 + ,15 + ,6 + ,4 + ,1 + ,1 + ,21 + ,6 + ,76 + ,6 + ,12 + ,2 + ,5 + ,1 + ,0 + ,24 + ,8 + ,86 + ,6 + ,10 + ,1 + ,1 + ,1 + ,1 + ,23 + ,10 + ,54 + ,4 + ,14 + ,2 + ,6 + ,1 + ,0 + ,23 + ,10 + ,69 + ,1 + ,9 + ,1 + ,5 + ,1 + ,0 + ,22 + ,10 + ,90 + ,3 + ,15 + ,2 + ,2 + ,1 + ,0 + ,22 + ,12 + ,54 + ,7 + ,15 + ,1 + ,1 + ,1 + ,0 + ,25 + ,10 + ,76 + ,2 + ,14 + ,3 + ,5 + ,1 + ,0 + ,23 + ,9 + ,89 + ,7 + ,11 + ,3 + ,6 + ,1 + ,0 + ,22 + ,9 + ,76 + ,4 + ,8 + ,6 + ,5 + ,1 + ,0 + ,21 + ,11 + ,79 + ,5 + ,11 + ,4 + ,5 + ,1 + ,0 + ,21 + ,7 + ,90 + ,6 + ,8 + ,1 + ,4 + ,1 + ,1 + ,22 + ,7 + ,74 + ,6 + ,10 + ,2 + ,2 + ,1 + ,0 + ,22 + ,5 + ,81 + ,5 + ,11 + ,5 + ,3 + ,1 + ,0 + ,21 + ,9 + ,72 + ,5 + ,13 + ,6 + ,3 + ,1 + ,0 + ,0 + ,11 + ,71 + ,4 + ,11 + ,3 + ,5 + ,1 + ,1 + ,21 + ,15 + ,66 + ,2 + ,20 + ,5 + ,3 + ,1 + ,1 + ,22 + ,9 + ,77 + ,2 + ,10 + ,3 + ,2 + ,1 + ,0 + ,21 + ,9 + ,74 + ,4 + ,12 + ,2 + ,2 + ,1 + ,1 + ,24 + ,8 + ,82 + ,4 + ,14 + ,3 + ,3 + ,1 + ,0 + ,21 + ,13 + ,54 + ,6 + ,23 + ,2 + ,6 + ,1 + ,1 + ,23 + ,10 + ,63 + ,5 + ,14 + ,5 + ,5 + ,1 + ,1 + ,23 + ,13 + ,54 + ,5 + ,16 + ,5 + ,6 + ,1 + ,0 + ,22 + ,9 + ,64 + ,6 + ,11 + ,7 + ,2 + ,1 + ,0 + ,21 + ,11 + ,69 + ,5 + ,12 + ,4 + ,5 + ,1 + ,1 + ,21 + ,8 + ,84 + ,7 + ,14 + ,5 + ,5 + ,1 + ,1 + ,21 + ,10 + ,86 + ,5 + ,12 + ,1 + ,1 + ,1 + ,0 + ,21 + ,9 + ,77 + ,3 + ,12 + ,4 + ,4 + ,1 + ,1 + ,22 + ,8 + ,89 + ,5 + ,11 + ,1 + ,2 + ,1 + ,0 + ,20 + ,8 + ,76 + ,1 + ,12 + ,4 + ,2 + ,1 + ,0 + ,21 + ,13 + ,60 + ,5 + ,13 + ,6 + ,7 + ,1 + ,1 + ,23 + ,11 + ,79 + ,7 + ,17 + ,7 + ,6 + ,1 + ,0 + ,32 + ,8 + ,76 + ,7 + ,11 + ,1 + ,5 + ,0 + ,1 + ,22 + ,12 + ,72 + ,6 + ,12 + ,3 + ,5 + ,1 + ,0 + ,24 + ,15 + ,69 + ,4 + ,19 + ,5 + ,5 + ,0 + ,0 + ,21 + ,11 + ,54 + ,2 + ,15 + ,2 + ,4 + ,1 + ,0 + ,22 + ,10 + ,69 + ,6 + ,14 + ,4 + ,3 + ,1 + ,0 + ,22 + ,5 + ,81 + ,5 + ,11 + ,5 + ,3 + ,1 + ,0 + ,23 + ,11 + ,84 + ,1 + ,9 + ,1 + ,3 + ,1 + ,0) + ,dim=c(9 + ,142) + ,dimnames=list(c('AGE' + ,'PStress' + ,'BelInSprt' + ,'KunnenRekRel' + ,'Depressie' + ,'Slaapgebrek' + ,'ToekZorgen' + ,'Pstress_OKT' + ,'Pstress_M') + ,1:142)) > y <- array(NA,dim=c(9,142),dimnames=list(c('AGE','PStress','BelInSprt','KunnenRekRel','Depressie','Slaapgebrek','ToekZorgen','Pstress_OKT','Pstress_M'),1:142)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par4 = 'no' > par3 = '3' > par2 = 'quantiles' > par1 = '2' > #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 () > #Author: Dr. Ian E. Holliday > #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/ > #Source of accompanying publication: > #Technical description: > library(party) Loading required package: survival Loading required package: splines Loading required package: grid Loading required package: modeltools Loading required package: stats4 Loading required package: coin Loading required package: mvtnorm Loading required package: zoo Attaching package: 'zoo' The following object(s) are masked from package:base : as.Date.numeric Loading required package: sandwich Loading required package: strucchange Loading required package: vcd Loading required package: MASS Loading required package: colorspace > library(Hmisc) Attaching package: 'Hmisc' The following object(s) are masked from package:survival : untangle.specials The following object(s) are masked from package:base : format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units > par1 <- as.numeric(par1) > par3 <- as.numeric(par3) > x <- data.frame(t(y)) > is.data.frame(x) [1] TRUE > x <- x[!is.na(x[,par1]),] > k <- length(x[1,]) > n <- length(x[,1]) > colnames(x)[par1] [1] "PStress" > x[,par1] [1] 10 6 13 12 8 6 10 10 9 9 7 5 14 6 10 10 7 10 8 6 10 12 7 15 8 [26] 10 13 8 11 7 9 10 8 15 9 7 11 9 8 8 12 13 9 11 8 10 13 12 12 9 [51] 8 9 12 12 16 11 13 10 9 14 13 12 9 9 10 8 9 9 11 7 11 9 11 9 8 [76] 9 8 9 10 9 17 7 11 9 10 11 8 12 10 7 9 7 12 8 13 9 15 8 14 14 [101] 9 13 11 10 6 8 10 10 10 12 10 9 9 11 7 7 5 9 11 15 9 9 8 13 10 [126] 13 9 11 8 10 9 8 8 13 11 8 12 15 11 10 5 11 > if (par2 == 'kmeans') { + cl <- kmeans(x[,par1], par3) + print(cl) + clm <- matrix(cbind(cl$centers,1:par3),ncol=2) + clm <- clm[sort.list(clm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + cl$cluster[cl$cluster==clm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + cl$cluster <- as.factor(cl$cluster) + print(cl$cluster) + x[,par1] <- cl$cluster + } > if (par2 == 'quantiles') { + x[,par1] <- cut2(x[,par1],g=par3) + } > if (par2 == 'hclust') { + hc <- hclust(dist(x[,par1])^2, 'cen') + print(hc) + memb <- cutree(hc, k = par3) + dum <- c(mean(x[memb==1,par1])) + for (i in 2:par3) { + dum <- c(dum, mean(x[memb==i,par1])) + } + hcm <- matrix(cbind(dum,1:par3),ncol=2) + hcm <- hcm[sort.list(hcm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + memb[memb==hcm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + memb <- as.factor(memb) + print(memb) + x[,par1] <- memb + } > if (par2=='equal') { + ed <- cut(as.numeric(x[,par1]),par3,labels=paste('C',1:par3,sep='')) + x[,par1] <- as.factor(ed) + } > table(x[,par1]) [ 5,10) [10,12) [12,17] 69 39 34 > colnames(x) [1] "AGE" "PStress" "BelInSprt" "KunnenRekRel" "Depressie" [6] "Slaapgebrek" "ToekZorgen" "Pstress_OKT" "Pstress_M" > colnames(x)[par1] [1] "PStress" > x[,par1] [1] [10,12) [ 5,10) [12,17] [12,17] [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [10,12) [ 5,10) [10] [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [10,12) [10,12) [ 5,10) [10,12) [19] [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [12,17] [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [10,12) [12,17] [28] [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [ 5,10) [37] [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [12,17] [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [46] [10,12) [12,17] [12,17] [12,17] [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [12,17] [55] [12,17] [10,12) [12,17] [10,12) [ 5,10) [12,17] [12,17] [12,17] [ 5,10) [64] [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [73] [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [12,17] [82] [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [10,12) [10,12) [ 5,10) [12,17] [10,12) [ 5,10) [91] [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [12,17] [ 5,10) [12,17] [100] [12,17] [ 5,10) [12,17] [10,12) [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [10,12) [109] [10,12) [12,17] [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [118] [ 5,10) [10,12) [12,17] [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [10,12) [12,17] [127] [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [10,12) [ 5,10) [ 5,10) [ 5,10) [12,17] [10,12) [136] [ 5,10) [12,17] [12,17] [10,12) [10,12) [ 5,10) [10,12) Levels: [ 5,10) [10,12) [12,17] > if (par2 == 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste(colnames(x)[par1],' ~ .',sep='')),data = x) + } > > #Note: the /var/www/html/freestat/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/www/html/freestat/rcomp/createtable") > > if (par2 != 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data = x) + if (par4=='yes') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'10-Fold Cross Validation',3+2*par3,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (training)',par3+1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (testing)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actual',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:10) { + ind <- sample(2, nrow(x), replace=T, prob=c(0.9,0.1)) + m.ct <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data =x[ind==1,]) + if (i==1) { + m.ct.i.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==1,]) + m.ct.i.actu <- x[ind==1,par1] + m.ct.x.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==2,]) + m.ct.x.actu <- x[ind==2,par1] + } else { + m.ct.i.pred <- c(m.ct.i.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==1,])) + m.ct.i.actu <- c(m.ct.i.actu,x[ind==1,par1]) + m.ct.x.pred <- c(m.ct.x.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==2,])) + m.ct.x.actu <- c(m.ct.x.actu,x[ind==2,par1]) + } + } + print(m.ct.i.tab <- table(m.ct.i.actu,m.ct.i.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.i.tab[i,i] / sum(m.ct.i.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.i.tab[i,i] + } + print(m.ct.i.cp <- numer / sum(m.ct.i.tab)) + print(m.ct.x.tab <- table(m.ct.x.actu,m.ct.x.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.x.tab[i,i] / sum(m.ct.x.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.x.tab[i,i] + } + print(m.ct.x.cp <- numer / sum(m.ct.x.tab)) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.i.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.i.tab[i,i]/sum(m.ct.i.tab[i,]),4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.x.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.x.tab[i,i]/sum(m.ct.x.tab[i,]),4)) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Overall',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.i.cp,4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.x.cp,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/14gew1292672862.tab") + } + } > m Conditional inference tree with 2 terminal nodes Response: as.factor(PStress) Inputs: AGE, BelInSprt, KunnenRekRel, Depressie, Slaapgebrek, ToekZorgen, Pstress_OKT, Pstress_M Number of observations: 142 1) Depressie <= 13; criterion = 1, statistic = 33.339 2)* weights = 95 1) Depressie > 13 3)* weights = 47 > postscript(file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/2x7dh1292672862.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(m) > dev.off() null device 1 > postscript(file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/3x7dh1292672862.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(x[,par1] ~ as.factor(where(m)),main='Response by Terminal Node',xlab='Terminal Node',ylab='Response') > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + forec <- predict(m) + result <- as.data.frame(cbind(x[,par1],forec,x[,par1]-forec)) + colnames(result) <- c('Actuals','Forecasts','Residuals') + print(result) + } > if (par2 != 'none') { + print(cbind(as.factor(x[,par1]),predict(m))) + myt <- table(as.factor(x[,par1]),predict(m)) + print(myt) + } [,1] [,2] [1,] 2 1 [2,] 1 1 [3,] 3 3 [4,] 3 1 [5,] 1 3 [6,] 1 1 [7,] 2 3 [8,] 2 1 [9,] 1 1 [10,] 1 1 [11,] 1 1 [12,] 1 1 [13,] 3 3 [14,] 1 1 [15,] 2 3 [16,] 2 3 [17,] 1 1 [18,] 2 1 [19,] 1 1 [20,] 1 1 [21,] 2 1 [22,] 3 3 [23,] 1 1 [24,] 3 1 [25,] 1 1 [26,] 2 3 [27,] 3 1 [28,] 1 1 [29,] 2 3 [30,] 1 1 [31,] 1 1 [32,] 2 1 [33,] 1 1 [34,] 3 3 [35,] 1 1 [36,] 1 1 [37,] 2 1 [38,] 1 1 [39,] 1 3 [40,] 1 1 [41,] 3 1 [42,] 3 1 [43,] 1 1 [44,] 2 1 [45,] 1 1 [46,] 2 3 [47,] 3 3 [48,] 3 3 [49,] 3 1 [50,] 1 1 [51,] 1 1 [52,] 1 1 [53,] 3 1 [54,] 3 3 [55,] 3 3 [56,] 2 1 [57,] 3 1 [58,] 2 3 [59,] 1 1 [60,] 3 1 [61,] 3 3 [62,] 3 1 [63,] 1 1 [64,] 1 3 [65,] 2 1 [66,] 1 3 [67,] 1 1 [68,] 1 1 [69,] 2 1 [70,] 1 1 [71,] 2 3 [72,] 1 1 [73,] 2 1 [74,] 1 1 [75,] 1 1 [76,] 1 1 [77,] 1 1 [78,] 1 1 [79,] 2 1 [80,] 1 1 [81,] 3 3 [82,] 1 1 [83,] 2 3 [84,] 1 1 [85,] 2 3 [86,] 2 1 [87,] 1 1 [88,] 3 3 [89,] 2 1 [90,] 1 1 [91,] 1 1 [92,] 1 1 [93,] 3 3 [94,] 1 1 [95,] 3 1 [96,] 1 3 [97,] 3 3 [98,] 1 1 [99,] 3 3 [100,] 3 3 [101,] 1 3 [102,] 3 3 [103,] 2 1 [104,] 2 3 [105,] 1 1 [106,] 1 1 [107,] 2 3 [108,] 2 1 [109,] 2 3 [110,] 3 3 [111,] 2 3 [112,] 1 1 [113,] 1 1 [114,] 2 1 [115,] 1 1 [116,] 1 1 [117,] 1 1 [118,] 1 1 [119,] 2 1 [120,] 3 3 [121,] 1 1 [122,] 1 1 [123,] 1 3 [124,] 3 3 [125,] 2 3 [126,] 3 3 [127,] 1 1 [128,] 2 1 [129,] 1 3 [130,] 2 1 [131,] 1 1 [132,] 1 1 [133,] 1 1 [134,] 3 1 [135,] 2 3 [136,] 1 1 [137,] 3 1 [138,] 3 3 [139,] 2 3 [140,] 2 3 [141,] 1 1 [142,] 2 1 [ 5,10) [10,12) [12,17] [ 5,10) 61 0 8 [10,12) 21 0 18 [12,17] 13 0 21 > postscript(file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/47yc21292672862.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > if(par2=='none') { + op <- par(mfrow=c(2,2)) + plot(density(result$Actuals),main='Kernel Density Plot of Actuals') + plot(density(result$Residuals),main='Kernel Density Plot of Residuals') + plot(result$Forecasts,result$Actuals,main='Actuals versus Predictions',xlab='Predictions',ylab='Actuals') + plot(density(result$Forecasts),main='Kernel Density Plot of Predictions') + par(op) + } > if(par2!='none') { + plot(myt,main='Confusion Matrix',xlab='Actual',ylab='Predicted') + } > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + detcoef <- cor(result$Forecasts,result$Actuals) + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Goodness of Fit',2,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Correlation',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'R-squared',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef*detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'RMSE',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(sqrt(mean((result$Residuals)^2)),4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/53qst1292672862.tab") + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actuals, Predictions, and Residuals',4,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'#',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Actuals',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Forecasts',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Residuals',header=TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:length(result$Actuals)) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,i,header=TRUE) + a<-table.element(a,result$Actuals[i]) + a<-table.element(a,result$Forecasts[i]) + a<-table.element(a,result$Residuals[i]) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/6wzrw1292672862.tab") + } > if (par2 != 'none') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Confusion Matrix (predicted in columns / actuals in rows)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + for (i in 1:par3) { + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + } + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (j in 1:par3) { + a<-table.element(a,myt[i,j]) + } + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/freestat/rcomp/tmp/7h0711292672862.tab") + } > > try(system("convert tmp/2x7dh1292672862.ps tmp/2x7dh1292672862.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/3x7dh1292672862.ps tmp/3x7dh1292672862.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/47yc21292672862.ps tmp/47yc21292672862.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 3.849 0.662 3.999