R version 2.9.0 (2009-04-17) Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(2 + ,24 + ,14 + ,11 + ,12 + ,24 + ,26 + ,2 + ,25 + ,11 + ,7 + ,8 + ,25 + ,23 + ,2 + ,17 + ,6 + ,17 + ,8 + ,30 + ,25 + ,1 + ,18 + ,12 + ,10 + ,8 + ,19 + ,23 + ,2 + ,18 + ,8 + ,12 + ,9 + ,22 + ,19 + ,2 + ,16 + ,10 + ,12 + ,7 + ,22 + ,29 + ,2 + ,20 + ,10 + ,11 + ,4 + ,25 + ,25 + ,2 + ,16 + ,11 + ,11 + ,11 + ,23 + ,21 + ,2 + ,18 + ,16 + ,12 + ,7 + ,17 + ,22 + ,2 + ,17 + ,11 + ,13 + ,7 + ,21 + ,25 + ,1 + ,23 + ,13 + ,14 + ,12 + ,19 + ,24 + ,2 + ,30 + ,12 + ,16 + ,10 + ,19 + ,18 + ,1 + ,23 + ,8 + ,11 + ,10 + ,15 + ,22 + ,2 + ,18 + ,12 + ,10 + ,8 + ,16 + ,15 + ,2 + ,15 + ,11 + ,11 + ,8 + ,23 + ,22 + ,1 + ,12 + ,4 + ,15 + ,4 + ,27 + ,28 + ,1 + ,21 + ,9 + ,9 + ,9 + ,22 + ,20 + ,2 + ,15 + ,8 + ,11 + ,8 + ,14 + ,12 + ,1 + ,20 + ,8 + ,17 + ,7 + ,22 + ,24 + ,2 + ,31 + ,14 + ,17 + ,11 + ,23 + ,20 + ,1 + ,27 + ,15 + ,11 + ,9 + ,23 + ,21 + ,2 + ,34 + ,16 + ,18 + ,11 + ,21 + ,20 + ,2 + ,21 + ,9 + ,14 + ,13 + ,19 + ,21 + ,2 + ,31 + ,14 + ,10 + ,8 + ,18 + ,23 + ,1 + ,19 + ,11 + ,11 + ,8 + ,20 + ,28 + ,2 + ,16 + ,8 + ,15 + ,9 + ,23 + ,24 + ,1 + ,20 + ,9 + ,15 + ,6 + ,25 + ,24 + ,2 + ,21 + ,9 + ,13 + ,9 + ,19 + ,24 + ,2 + ,22 + ,9 + ,16 + ,9 + ,24 + ,23 + ,1 + ,17 + ,9 + ,13 + ,6 + ,22 + ,23 + ,2 + ,24 + ,10 + ,9 + ,6 + ,25 + ,29 + ,1 + ,25 + ,16 + ,18 + ,16 + ,26 + ,24 + ,2 + ,26 + ,11 + ,18 + ,5 + ,29 + ,18 + ,2 + ,25 + ,8 + ,12 + ,7 + ,32 + ,25 + ,1 + ,17 + ,9 + ,17 + ,9 + ,25 + ,21 + ,1 + ,32 + ,16 + ,9 + ,6 + ,29 + ,26 + ,1 + ,33 + ,11 + ,9 + ,6 + ,28 + ,22 + ,1 + ,13 + ,16 + ,12 + ,5 + ,17 + ,22 + ,2 + ,32 + ,12 + ,18 + ,12 + ,28 + ,22 + ,1 + ,25 + ,12 + ,12 + ,7 + ,29 + ,23 + ,1 + ,29 + ,14 + ,18 + ,10 + ,26 + ,30 + ,2 + ,22 + ,9 + ,14 + ,9 + ,25 + ,23 + ,1 + ,18 + ,10 + ,15 + ,8 + ,14 + ,17 + ,1 + ,17 + ,9 + ,16 + ,5 + ,25 + ,23 + ,2 + ,20 + ,10 + ,10 + ,8 + ,26 + ,23 + ,2 + ,15 + ,12 + ,11 + ,8 + ,20 + ,25 + ,2 + ,20 + ,14 + ,14 + ,10 + ,18 + ,24 + ,2 + ,33 + ,14 + ,9 + ,6 + ,32 + ,24 + ,2 + ,29 + ,10 + ,12 + ,8 + ,25 + ,23 + ,1 + ,23 + ,14 + ,17 + ,7 + ,25 + ,21 + ,2 + ,26 + ,16 + ,5 + ,4 + ,23 + ,24 + ,1 + ,18 + ,9 + ,12 + ,8 + ,21 + ,24 + ,1 + ,20 + ,10 + ,12 + ,8 + ,20 + ,28 + ,2 + ,11 + ,6 + ,6 + ,4 + ,15 + ,16 + ,1 + ,28 + ,8 + ,24 + ,20 + ,30 + ,20 + ,2 + ,26 + ,13 + ,12 + ,8 + ,24 + ,29 + ,2 + ,22 + ,10 + ,12 + ,8 + ,26 + ,27 + ,2 + ,17 + ,8 + ,14 + ,6 + ,24 + ,22 + ,1 + ,12 + ,7 + ,7 + ,4 + ,22 + ,28 + ,2 + ,14 + ,15 + ,13 + ,8 + ,14 + ,16 + ,1 + ,17 + ,9 + ,12 + ,9 + ,24 + ,25 + ,1 + ,21 + ,10 + ,13 + ,6 + ,24 + ,24 + ,2 + ,19 + ,12 + ,14 + ,7 + ,24 + ,28 + ,2 + ,18 + ,13 + ,8 + ,9 + ,24 + ,24 + ,2 + ,10 + ,10 + ,11 + ,5 + ,19 + ,23 + ,1 + ,29 + ,11 + ,9 + ,5 + ,31 + ,30 + ,2 + ,31 + ,8 + ,11 + ,8 + ,22 + ,24 + ,1 + ,19 + ,9 + ,13 + ,8 + ,27 + ,21 + ,2 + ,9 + ,13 + ,10 + ,6 + ,19 + ,25 + ,1 + ,20 + ,11 + ,11 + ,8 + ,25 + ,25 + ,1 + ,28 + ,8 + ,12 + ,7 + ,20 + ,22 + ,2 + ,19 + ,9 + ,9 + ,7 + ,21 + ,23 + ,2 + ,30 + ,9 + ,15 + ,9 + ,27 + ,26 + ,1 + ,29 + ,15 + ,18 + ,11 + ,23 + ,23 + ,1 + ,26 + ,9 + ,15 + ,6 + ,25 + ,25 + ,2 + ,23 + ,10 + ,12 + ,8 + ,20 + ,21 + ,2 + ,13 + ,14 + ,13 + ,6 + ,21 + ,25 + ,2 + ,21 + ,12 + ,14 + ,9 + ,22 + ,24 + ,1 + ,19 + ,12 + ,10 + ,8 + ,23 + ,29 + ,1 + ,28 + ,11 + ,13 + ,6 + ,25 + ,22 + ,1 + ,23 + ,14 + ,13 + ,10 + ,25 + ,27 + ,1 + ,18 + ,6 + ,11 + ,8 + ,17 + ,26 + ,2 + ,21 + ,12 + ,13 + ,8 + ,19 + ,22 + ,1 + ,20 + ,8 + ,16 + ,10 + ,25 + ,24 + ,2 + ,23 + ,14 + ,8 + ,5 + ,19 + ,27 + ,2 + ,21 + ,11 + ,16 + ,7 + ,20 + ,24 + ,1 + ,21 + ,10 + ,11 + ,5 + ,26 + ,24 + ,2 + ,15 + ,14 + ,9 + ,8 + ,23 + ,29 + ,2 + ,28 + ,12 + ,16 + ,14 + ,27 + ,22 + ,2 + ,19 + ,10 + ,12 + ,7 + ,17 + ,21 + ,2 + ,26 + ,14 + ,14 + ,8 + ,17 + ,24 + ,2 + ,10 + ,5 + ,8 + ,6 + ,19 + ,24 + ,2 + ,16 + ,11 + ,9 + ,5 + ,17 + ,23 + ,2 + ,22 + ,10 + ,15 + ,6 + ,22 + ,20 + ,2 + ,19 + ,9 + ,11 + ,10 + ,21 + ,27 + ,2 + ,31 + ,10 + ,21 + ,12 + ,32 + ,26 + ,2 + ,31 + ,16 + ,14 + ,9 + ,21 + ,25 + ,2 + ,29 + ,13 + ,18 + ,12 + ,21 + ,21 + ,1 + ,19 + ,9 + ,12 + ,7 + ,18 + ,21 + ,1 + ,22 + ,10 + ,13 + ,8 + ,18 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+ ,20 + ,11 + ,17 + ,8 + ,21 + ,23 + ,1 + ,15 + ,8 + ,10 + ,4 + ,22 + ,24 + ,2 + ,20 + ,11 + ,11 + ,8 + ,24 + ,26 + ,2 + ,18 + ,10 + ,14 + ,9 + ,21 + ,26 + ,2 + ,33 + ,14 + ,11 + ,8 + ,26 + ,25 + ,1 + ,22 + ,11 + ,13 + ,11 + ,24 + ,18 + ,1 + ,16 + ,9 + ,12 + ,8 + ,16 + ,21 + ,2 + ,17 + ,9 + ,11 + ,5 + ,23 + ,26 + ,1 + ,16 + ,8 + ,9 + ,4 + ,18 + ,23 + ,1 + ,21 + ,10 + ,12 + ,8 + ,16 + ,23 + ,2 + ,26 + ,13 + ,20 + ,10 + ,26 + ,22 + ,1 + ,18 + ,13 + ,12 + ,6 + ,19 + ,20 + ,1 + ,18 + ,12 + ,13 + ,9 + ,21 + ,13 + ,2 + ,17 + ,8 + ,12 + ,9 + ,21 + ,24 + ,2 + ,22 + ,13 + ,12 + ,13 + ,22 + ,15 + ,1 + ,30 + ,14 + ,9 + ,9 + ,23 + ,14 + ,2 + ,30 + ,12 + ,15 + ,10 + ,29 + ,22 + ,1 + ,24 + ,14 + ,24 + ,20 + ,21 + ,10 + ,2 + ,21 + ,15 + ,7 + ,5 + ,21 + ,24 + ,1 + ,21 + ,13 + ,17 + ,11 + ,23 + ,22 + ,2 + ,29 + ,16 + ,11 + ,6 + ,27 + ,24 + ,2 + ,31 + ,9 + ,17 + ,9 + ,25 + ,19 + ,1 + ,20 + ,9 + ,11 + ,7 + ,21 + ,20 + ,1 + ,16 + ,9 + ,12 + ,9 + ,10 + ,13 + ,1 + ,22 + ,8 + ,14 + ,10 + ,20 + ,20 + ,2 + ,20 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Holliday > #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/ > #Source of accompanying publication: > #Technical description: > library(party) Loading required package: survival Loading required package: splines Loading required package: grid Loading required package: modeltools Loading required package: stats4 Loading required package: coin Loading required package: mvtnorm Loading required package: zoo Attaching package: 'zoo' The following object(s) are masked from package:base : as.Date.numeric Loading required package: sandwich Loading required package: strucchange Loading required package: vcd Loading required package: MASS Loading required package: colorspace > library(Hmisc) Attaching package: 'Hmisc' The following object(s) are masked from package:survival : untangle.specials The following object(s) are masked from package:base : format.pval, round.POSIXt, trunc.POSIXt, units > par1 <- as.numeric(par1) > par3 <- as.numeric(par3) > x <- data.frame(t(y)) > is.data.frame(x) [1] TRUE > x <- x[!is.na(x[,par1]),] > k <- length(x[1,]) > n <- length(x[,1]) > colnames(x)[par1] [1] "PC" > x[,par1] [1] 12 8 8 8 9 7 4 11 7 7 12 10 10 8 8 4 9 8 7 11 9 11 13 8 8 [26] 9 6 9 9 6 6 16 5 7 9 6 6 5 12 7 10 9 8 5 8 8 10 6 8 7 [51] 4 8 8 4 20 8 8 6 4 8 9 6 7 9 5 5 8 8 6 8 7 7 9 11 6 [76] 8 6 9 8 6 10 8 8 10 5 7 5 8 14 7 8 6 5 6 10 12 9 12 7 8 [101] 10 6 10 10 10 5 7 10 11 6 7 12 11 11 11 5 8 6 9 4 4 7 11 6 7 [126] 8 4 8 9 8 11 8 5 4 8 10 6 9 9 13 9 10 20 5 11 6 9 7 9 10 [151] 9 8 7 6 13 6 8 10 16 > if (par2 == 'kmeans') { + cl <- kmeans(x[,par1], par3) + print(cl) + clm <- matrix(cbind(cl$centers,1:par3),ncol=2) + clm <- clm[sort.list(clm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + cl$cluster[cl$cluster==clm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + cl$cluster <- as.factor(cl$cluster) + print(cl$cluster) + x[,par1] <- cl$cluster + } > if (par2 == 'quantiles') { + x[,par1] <- cut2(x[,par1],g=par3) + } > if (par2 == 'hclust') { + hc <- hclust(dist(x[,par1])^2, 'cen') + print(hc) + memb <- cutree(hc, k = par3) + dum <- c(mean(x[memb==1,par1])) + for (i in 2:par3) { + dum <- c(dum, mean(x[memb==i,par1])) + } + hcm <- matrix(cbind(dum,1:par3),ncol=2) + hcm <- hcm[sort.list(hcm[,1]),] + for (i in 1:par3) { + memb[memb==hcm[i,2]] <- paste('C',i,sep='') + } + memb <- as.factor(memb) + print(memb) + x[,par1] <- memb + } > if (par2=='equal') { + ed <- cut(as.numeric(x[,par1]),par3,labels=paste('C',1:par3,sep='')) + x[,par1] <- as.factor(ed) + } > table(x[,par1]) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [11,20] 43 54 37 25 > colnames(x) [1] "G" "CM" "DA" "PE" "PC" "PS" "O" > colnames(x)[par1] [1] "PC" > x[,par1] [1] [11,20] [ 7, 9) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 9,11) [ 7, 9) [ 4, 7) [11,20] [ 7, 9) [10] [ 7, 9) [11,20] [ 9,11) [ 9,11) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 9,11) [ 7, 9) [19] [ 7, 9) [11,20] [ 9,11) [11,20] [11,20] [ 7, 9) [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [28] [ 9,11) [ 9,11) [ 4, 7) [ 4, 7) [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [37] [ 4, 7) [ 4, 7) [11,20] [ 7, 9) [ 9,11) [ 9,11) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 7, 9) [46] [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 4, 7) [55] [11,20] [ 7, 9) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [ 7, 9) [64] [ 9,11) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 7, 9) [ 7, 9) [73] [ 9,11) [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 9,11) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 9,11) [82] [ 7, 9) [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 4, 7) [ 7, 9) [11,20] [ 7, 9) [91] [ 7, 9) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 9,11) [11,20] [ 9,11) [11,20] [ 7, 9) [100] [ 7, 9) [ 9,11) [ 4, 7) [ 9,11) [ 9,11) [ 9,11) [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [109] [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [11,20] [11,20] [11,20] [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [118] [ 4, 7) [ 9,11) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 7, 9) [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [ 7, 9) [127] [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [ 7, 9) [11,20] [ 7, 9) [ 4, 7) [ 4, 7) [ 7, 9) [136] [ 9,11) [ 4, 7) [ 9,11) [ 9,11) [11,20] [ 9,11) [ 9,11) [11,20] [ 4, 7) [145] [11,20] [ 4, 7) [ 9,11) [ 7, 9) [ 9,11) [ 9,11) [ 9,11) [ 7, 9) [ 7, 9) [154] [ 4, 7) [11,20] [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [11,20] Levels: [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [11,20] > if (par2 == 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste(colnames(x)[par1],' ~ .',sep='')),data = x) + } > > #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/www/html/rcomp/createtable") > > if (par2 != 'none') { + m <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data = x) + if (par4=='yes') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'10-Fold Cross Validation',3+2*par3,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (training)',par3+1,TRUE) + a<-table.element(a,'Prediction (testing)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actual',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,paste('C',jjj,sep=''),1,TRUE) + a<-table.element(a,'CV',1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:10) { + ind <- sample(2, nrow(x), replace=T, prob=c(0.9,0.1)) + m.ct <- ctree(as.formula(paste('as.factor(',colnames(x)[par1],') ~ .',sep='')),data =x[ind==1,]) + if (i==1) { + m.ct.i.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==1,]) + m.ct.i.actu <- x[ind==1,par1] + m.ct.x.pred <- predict(m.ct, newdata=x[ind==2,]) + m.ct.x.actu <- x[ind==2,par1] + } else { + m.ct.i.pred <- c(m.ct.i.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==1,])) + m.ct.i.actu <- c(m.ct.i.actu,x[ind==1,par1]) + m.ct.x.pred <- c(m.ct.x.pred,predict(m.ct, newdata=x[ind==2,])) + m.ct.x.actu <- c(m.ct.x.actu,x[ind==2,par1]) + } + } + print(m.ct.i.tab <- table(m.ct.i.actu,m.ct.i.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.i.tab[i,i] / sum(m.ct.i.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.i.tab[i,i] + } + print(m.ct.i.cp <- numer / sum(m.ct.i.tab)) + print(m.ct.x.tab <- table(m.ct.x.actu,m.ct.x.pred)) + numer <- 0 + for (i in 1:par3) { + print(m.ct.x.tab[i,i] / sum(m.ct.x.tab[i,])) + numer <- numer + m.ct.x.tab[i,i] + } + print(m.ct.x.cp <- numer / sum(m.ct.x.tab)) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.i.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.i.tab[i,i]/sum(m.ct.i.tab[i,]),4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,m.ct.x.tab[i,jjj]) + a<-table.element(a,round(m.ct.x.tab[i,i]/sum(m.ct.x.tab[i,]),4)) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Overall',1,TRUE) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.i.cp,4)) + for (jjj in 1:par3) a<-table.element(a,'-') + a<-table.element(a,round(m.ct.x.cp,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/1wxk71292928725.tab") + } + } > m Conditional inference tree with 4 terminal nodes Response: as.factor(PC) Inputs: G, CM, DA, PE, PS, O Number of observations: 159 1) PE <= 17; criterion = 1, statistic = 40.479 2) PE <= 9; criterion = 0.999, statistic = 20.934 3)* weights = 26 2) PE > 9 4) PE <= 12; criterion = 0.967, statistic = 12.579 5)* weights = 58 4) PE > 12 6)* weights = 59 1) PE > 17 7)* weights = 16 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/2wxk71292928725.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(m) > dev.off() null device 1 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/3wxk71292928725.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > plot(x[,par1] ~ as.factor(where(m)),main='Response by Terminal Node',xlab='Terminal Node',ylab='Response') > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + forec <- predict(m) + result <- as.data.frame(cbind(x[,par1],forec,x[,par1]-forec)) + colnames(result) <- c('Actuals','Forecasts','Residuals') + print(result) + } > if (par2 != 'none') { + print(cbind(as.factor(x[,par1]),predict(m))) + myt <- table(as.factor(x[,par1]),predict(m)) + print(myt) + } [,1] [,2] [1,] 4 2 [2,] 2 1 [3,] 2 3 [4,] 2 2 [5,] 3 2 [6,] 2 2 [7,] 1 2 [8,] 4 2 [9,] 2 2 [10,] 2 3 [11,] 4 3 [12,] 3 3 [13,] 3 2 [14,] 2 2 [15,] 2 2 [16,] 1 3 [17,] 3 1 [18,] 2 2 [19,] 2 3 [20,] 4 3 [21,] 3 2 [22,] 4 4 [23,] 4 3 [24,] 2 2 [25,] 2 2 [26,] 3 3 [27,] 1 3 [28,] 3 3 [29,] 3 3 [30,] 1 3 [31,] 1 1 [32,] 4 4 [33,] 1 4 [34,] 2 2 [35,] 3 3 [36,] 1 1 [37,] 1 1 [38,] 1 2 [39,] 4 4 [40,] 2 2 [41,] 3 4 [42,] 3 3 [43,] 2 3 [44,] 1 3 [45,] 2 2 [46,] 2 2 [47,] 3 3 [48,] 1 1 [49,] 2 2 [50,] 2 3 [51,] 1 1 [52,] 2 2 [53,] 2 2 [54,] 1 1 [55,] 4 4 [56,] 2 2 [57,] 2 2 [58,] 1 3 [59,] 1 1 [60,] 2 3 [61,] 3 2 [62,] 1 3 [63,] 2 3 [64,] 3 1 [65,] 1 2 [66,] 1 1 [67,] 2 2 [68,] 2 3 [69,] 1 2 [70,] 2 2 [71,] 2 2 [72,] 2 1 [73,] 3 3 [74,] 4 4 [75,] 1 3 [76,] 2 2 [77,] 1 3 [78,] 3 3 [79,] 2 2 [80,] 1 3 [81,] 3 3 [82,] 2 2 [83,] 2 3 [84,] 3 3 [85,] 1 1 [86,] 2 3 [87,] 1 2 [88,] 2 1 [89,] 4 3 [90,] 2 2 [91,] 2 3 [92,] 1 1 [93,] 1 1 [94,] 1 3 [95,] 3 2 [96,] 4 4 [97,] 3 3 [98,] 4 4 [99,] 2 2 [100,] 2 3 [101,] 3 3 [102,] 1 2 [103,] 3 4 [104,] 3 3 [105,] 3 2 [106,] 1 2 [107,] 2 2 [108,] 3 3 [109,] 4 3 [110,] 1 2 [111,] 2 2 [112,] 4 3 [113,] 4 1 [114,] 4 4 [115,] 4 1 [116,] 1 3 [117,] 2 3 [118,] 1 1 [119,] 3 3 [120,] 1 1 [121,] 1 1 [122,] 2 2 [123,] 4 3 [124,] 1 1 [125,] 2 1 [126,] 2 3 [127,] 1 2 [128,] 2 2 [129,] 3 3 [130,] 2 2 [131,] 4 3 [132,] 2 2 [133,] 1 2 [134,] 1 1 [135,] 2 2 [136,] 3 4 [137,] 1 2 [138,] 3 3 [139,] 3 2 [140,] 4 2 [141,] 3 1 [142,] 3 3 [143,] 4 4 [144,] 1 1 [145,] 4 3 [146,] 1 2 [147,] 3 3 [148,] 2 2 [149,] 3 2 [150,] 3 3 [151,] 3 2 [152,] 2 3 [153,] 2 4 [154,] 1 3 [155,] 4 4 [156,] 1 3 [157,] 2 2 [158,] 3 3 [159,] 4 4 [ 4, 7) [ 7, 9) [ 9,11) [11,20] [ 4, 7) 17 12 13 1 [ 7, 9) 4 34 15 1 [ 9,11) 3 9 22 3 [11,20] 2 3 9 11 > postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/4opka1292928725.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > if(par2=='none') { + op <- par(mfrow=c(2,2)) + plot(density(result$Actuals),main='Kernel Density Plot of Actuals') + plot(density(result$Residuals),main='Kernel Density Plot of Residuals') + plot(result$Forecasts,result$Actuals,main='Actuals versus Predictions',xlab='Predictions',ylab='Actuals') + plot(density(result$Forecasts),main='Kernel Density Plot of Predictions') + par(op) + } > if(par2!='none') { + plot(myt,main='Confusion Matrix',xlab='Actual',ylab='Predicted') + } > dev.off() null device 1 > if (par2 == 'none') { + detcoef <- cor(result$Forecasts,result$Actuals) + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Goodness of Fit',2,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Correlation',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'R-squared',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(detcoef*detcoef,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'RMSE',1,TRUE) + a<-table.element(a,round(sqrt(mean((result$Residuals)^2)),4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/52ghi1292928725.tab") + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Actuals, Predictions, and Residuals',4,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'#',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Actuals',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Forecasts',header=TRUE) + a<-table.element(a,'Residuals',header=TRUE) + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:length(result$Actuals)) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,i,header=TRUE) + a<-table.element(a,result$Actuals[i]) + a<-table.element(a,result$Forecasts[i]) + a<-table.element(a,result$Residuals[i]) + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/6vqzm1292928725.tab") + } > if (par2 != 'none') { + a<-table.start() + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'Confusion Matrix (predicted in columns / actuals in rows)',par3+1,TRUE) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'',1,TRUE) + for (i in 1:par3) { + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + } + a<-table.row.end(a) + for (i in 1:par3) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,paste('C',i,sep=''),1,TRUE) + for (j in 1:par3) { + a<-table.element(a,myt[i,j]) + } + a<-table.row.end(a) + } + a<-table.end(a) + table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/7z8f91292928725.tab") + } > > try(system("convert tmp/2wxk71292928725.ps tmp/2wxk71292928725.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/3wxk71292928725.ps tmp/3wxk71292928725.png",intern=TRUE)) character(0) > try(system("convert tmp/4opka1292928725.ps tmp/4opka1292928725.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 2.327 0.503 9.679