R version 2.9.0 (2009-04-17)
Copyright (C) 2009 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.

R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

> x <- array(list(89
+ ,69
+ ,62
+ ,67
+ ,83
+ ,73
+ ,90
+ ,69
+ ,62
+ ,67
+ ,102
+ ,73
+ ,82
+ ,69
+ ,62
+ ,67
+ ,75
+ ,73
+ ,82
+ ,69
+ ,62
+ ,67
+ ,92
+ ,73
+ ,71
+ ,69
+ ,68
+ ,67
+ ,94
+ ,73
+ ,80
+ ,69
+ ,70
+ ,67
+ ,88
+ ,73
+ ,62
+ ,75
+ ,71
+ ,69
+ ,77
+ ,73
+ ,77
+ ,77
+ ,71
+ ,72
+ ,63
+ ,74
+ ,80
+ ,79
+ ,72
+ ,72
+ ,73
+ ,75
+ ,87
+ ,79
+ ,72
+ ,73
+ ,85
+ ,77
+ ,96
+ ,81
+ ,72
+ ,73
+ ,80
+ ,77
+ ,80
+ ,81
+ ,72
+ ,73
+ ,77
+ ,77
+ ,85
+ ,83
+ ,72
+ ,73
+ ,67
+ ,78
+ ,89
+ ,83
+ ,72
+ ,75
+ ,98
+ ,79
+ ,89
+ ,83
+ ,72
+ ,77
+ ,89
+ ,80
+ ,73
+ ,83
+ ,72
+ ,78
+ ,63
+ ,81
+ ,88
+ ,84
+ ,72
+ ,79
+ ,97
+ ,81
+ ,86
+ ,84
+ ,72
+ ,80
+ ,77
+ ,82
+ ,83
+ ,84
+ ,73
+ ,80
+ ,96
+ ,82
+ ,91
+ ,84
+ ,74
+ ,81
+ ,84
+ ,82
+ ,98
+ ,84
+ ,74
+ ,81
+ ,94
+ ,82
+ ,80
+ ,84
+ ,75
+ ,82
+ ,70
+ ,82
+ ,84
+ ,85
+ ,75
+ ,83
+ ,100
+ ,82
+ ,90
+ ,85
+ ,75
+ ,83
+ ,88
+ ,83
+ ,92
+ ,85
+ ,75
+ ,83
+ ,97
+ ,83
+ ,86
+ ,86
+ ,75
+ ,84
+ ,78
+ ,83
+ ,117
+ ,86
+ ,75
+ ,84
+ ,108
+ ,83
+ ,88
+ ,86
+ ,75
+ ,84
+ ,81
+ ,83
+ ,86
+ ,86
+ ,77
+ ,84
+ ,96
+ ,83
+ ,78
+ ,86
+ ,77
+ ,84
+ ,84
+ ,84
+ ,104
+ ,86
+ ,78
+ ,84
+ ,104
+ ,84
+ ,89
+ ,86
+ ,78
+ ,84
+ ,87
+ ,84
+ ,99
+ ,87
+ ,78
+ ,84
+ ,98
+ ,84
+ ,84
+ ,87
+ ,78
+ ,85
+ ,89
+ ,84
+ ,89
+ ,87
+ ,79
+ ,86
+ ,93
+ ,85
+ ,95
+ ,87
+ ,79
+ ,86
+ ,89
+ ,86
+ ,58
+ ,87
+ ,79
+ ,87
+ ,63
+ ,86
+ ,77
+ ,87
+ ,80
+ ,87
+ ,84
+ ,86
+ ,77
+ ,88
+ ,80
+ ,87
+ ,82
+ ,86
+ ,98
+ ,88
+ ,81
+ ,87
+ ,105
+ ,87
+ ,58
+ ,88
+ ,81
+ ,88
+ ,70
+ ,88
+ ,81
+ ,88
+ ,81
+ ,88
+ ,94
+ ,88
+ ,92
+ ,88
+ ,82
+ ,88
+ ,101
+ ,88
+ ,94
+ ,88
+ ,82
+ ,89
+ ,83
+ ,89
+ ,87
+ ,88
+ ,82
+ ,89
+ ,88
+ ,89
+ ,75
+ ,88
+ ,82
+ ,89
+ ,69
+ ,89
+ ,80
+ ,88
+ ,82
+ ,89
+ ,94
+ ,89
+ ,84
+ ,88
+ ,82
+ ,89
+ ,82
+ ,89
+ ,87
+ ,89
+ ,82
+ ,89
+ ,82
+ ,89
+ ,114
+ ,89
+ ,82
+ ,89
+ ,109
+ ,90
+ ,97
+ ,90
+ ,82
+ ,90
+ ,86
+ ,90
+ ,102
+ ,90
+ ,82
+ ,90
+ ,99
+ ,90
+ ,80
+ ,90
+ ,84
+ ,90
+ ,82
+ ,90
+ ,112
+ ,91
+ ,85
+ ,90
+ ,114
+ ,90
+ ,104
+ ,91
+ ,85
+ ,90
+ ,99
+ ,91
+ ,75
+ ,91
+ ,85
+ ,90
+ ,91
+ ,91
+ ,82
+ ,92
+ ,86
+ ,90
+ ,81
+ ,91
+ ,92
+ ,92
+ ,87
+ ,91
+ ,102
+ ,92
+ ,102
+ ,92
+ ,87
+ ,91
+ ,101
+ ,92
+ ,73
+ ,92
+ ,87
+ ,91
+ ,72
+ ,92
+ ,78
+ ,93
+ ,87
+ ,92
+ ,91
+ ,92
+ ,74
+ ,93
+ ,88
+ ,92
+ ,83
+ ,92
+ ,92
+ ,93
+ ,88
+ ,94
+ ,102
+ ,92
+ ,97
+ ,93
+ ,88
+ ,94
+ ,103
+ ,92
+ ,92
+ ,93
+ ,88
+ ,94
+ ,93
+ ,93
+ ,91
+ ,94
+ ,88
+ ,94
+ ,88
+ ,93
+ ,102
+ ,94
+ ,88
+ ,94
+ ,110
+ ,93
+ ,89
+ ,94
+ ,89
+ ,94
+ ,100
+ ,93
+ ,98
+ ,94
+ ,89
+ ,95
+ ,88
+ ,93
+ ,117
+ ,95
+ ,89
+ ,95
+ ,119
+ ,93
+ ,92
+ ,95
+ ,90
+ ,96
+ ,98
+ ,94
+ ,70
+ ,95
+ ,90
+ ,96
+ ,90
+ ,94
+ ,63
+ ,95
+ ,90
+ ,96
+ ,69
+ ,94
+ ,91
+ ,95
+ ,90
+ ,96
+ ,98
+ ,95
+ ,106
+ ,96
+ ,90
+ ,96
+ ,98
+ ,95
+ ,81
+ ,97
+ ,91
+ ,97
+ ,81
+ ,96
+ ,98
+ ,97
+ ,91
+ ,97
+ ,93
+ ,96
+ ,88
+ ,99
+ ,91
+ ,98
+ ,91
+ ,96
+ ,95
+ ,100
+ ,91
+ ,98
+ ,86
+ ,97
+ ,105
+ ,101
+ ,91
+ ,98
+ ,95
+ ,97
+ ,90
+ ,101
+ ,91
+ ,100
+ ,87
+ ,97
+ ,58
+ ,101
+ ,91
+ ,100
+ ,63
+ ,98
+ ,86
+ ,102
+ ,91
+ ,101
+ ,89
+ ,98
+ ,112
+ ,102
+ ,91
+ ,102
+ ,108
+ ,98
+ ,71
+ ,102
+ ,92
+ ,103
+ ,99
+ ,98
+ ,98
+ ,102
+ ,92
+ ,104
+ ,90
+ ,99
+ ,87
+ ,103
+ ,92
+ ,105
+ ,91
+ ,99
+ ,98
+ ,103
+ ,92
+ ,105
+ ,82
+ ,100
+ ,117
+ ,103
+ ,92
+ ,105
+ ,119
+ ,100
+ ,98
+ ,104
+ ,92
+ ,105
+ ,97
+ ,100
+ ,98
+ ,104
+ ,92
+ ,105
+ ,108
+ ,100
+ ,90
+ ,105
+ ,93
+ ,106
+ ,101
+ ,101
+ ,84
+ ,105
+ ,93
+ ,106
+ ,96
+ ,102
+ ,86
+ ,105
+ ,93
+ ,107
+ ,97
+ ,104
+ ,68
+ ,105
+ ,93
+ ,107
+ ,69
+ ,104
+ ,86
+ ,105
+ ,93
+ ,107
+ ,89
+ ,105
+ ,77
+ ,105
+ ,93
+ ,110
+ ,84
+ ,107
+ ,83
+ ,108
+ ,95
+ ,110
+ ,79
+ ,107
+ ,90
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,103
+ ,107
+ ,107
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,92
+ ,107
+ ,102
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,104
+ ,107
+ ,90
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,102
+ ,107
+ ,113
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,106
+ ,107
+ ,86
+ ,113
+ ,95
+ ,111
+ ,93
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,108
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,119
+ ,NA
+ ,82
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,89
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,83
+ ,NA
+ ,99
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,92
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,96
+ ,NA
+ ,119
+ ,NA
+ ,91
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,92
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,103
+ ,NA
+ ,91
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,82
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,73
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,88
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,84
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,87
+ ,NA
+ ,80
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,96
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,88
+ ,NA
+ ,117
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,88
+ ,NA
+ ,99
+ ,NA
+ ,79
+ ,NA
+ ,99
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,90
+ ,NA
+ ,89
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,83
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,100
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,89
+ ,NA
+ ,58
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,64
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,108
+ ,NA
+ ,58
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,80
+ ,NA
+ ,81
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,83
+ ,NA
+ ,90
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,96
+ ,NA
+ ,112
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,108
+ ,NA
+ ,84
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,84
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,88
+ ,NA
+ ,75
+ ,NA
+ ,104
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,78
+ ,NA
+ ,104
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,94
+ ,NA
+ ,104
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,75
+ ,NA
+ ,104
+ ,NA
+ ,92
+ ,NA
+ ,82
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,91
+ ,NA
+ ,87
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,92
+ ,NA
+ ,59
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,72
+ ,NA
+ ,68
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,88
+ ,NA
+ ,80
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,99
+ ,NA
+ ,94
+ ,NA
+ ,105
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,87
+ ,NA
+ ,106
+ ,NA
+ ,83
+ ,NA
+ ,70
+ ,NA
+ ,106
+ ,NA
+ ,68
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,108
+ ,NA
+ ,101
+ ,NA
+ ,99
+ ,NA
+ ,109
+ ,NA
+ ,91
+ ,NA
+ ,90
+ ,NA
+ ,109
+ ,NA
+ ,89
+ ,NA
+ ,102
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,80
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,89
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,110
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,95
+ ,NA
+ ,111
+ ,NA
+ ,98
+ ,NA
+ ,104
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,83
+ ,NA
+ ,84
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,92
+ ,NA
+ ,85
+ ,NA
+ ,114
+ ,NA
+ ,113
+ ,NA
+ ,90
+ ,NA
+ ,114
+ ,NA
+ ,103
+ ,NA
+ ,86
+ ,NA
+ ,114
+ ,NA
+ ,96
+ ,NA
+ ,97
+ ,NA
+ ,114
+ ,NA
+ ,94
+ ,NA)
+ ,dim=c(6
+ ,162)
+ ,dimnames=list(c('WJ7ARD'
+ ,'WJ10ARD'
+ ,'WJ7AMA'
+ ,'WJ10AMA'
+ ,'WJ7AKN'
+ ,'WJ10AKN')
+ ,1:162))
>  y <- array(NA,dim=c(6,162),dimnames=list(c('WJ7ARD','WJ10ARD','WJ7AMA','WJ10AMA','WJ7AKN','WJ10AKN'),1:162))
>  for (i in 1:dim(x)[1])
+  {
+  	for (j in 1:dim(x)[2])
+  	{
+  		y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
+  	}
+  }
> par3 = '0'
> par2 = 'FALSE'
> par1 = '3'
> ylab = 'Test Scores'
> xlab = 'CARE Variable Names'
> main = 'CARE DATA'
> #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 ()
> #Author: Dr. Ian E. Holliday
> #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, CARE BoxPlot and Descriptives (v1.0.1) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/Ian.Holliday/rwasp_varia1.wasp/
> #Source of accompanying publication: 
> #Technical description: 
> par1 <- as.numeric(par1) #colour
> par2<- as.logical(par2) # Notches ?
> par3<-as.numeric(par3) # % trim
> if(par3>45){par3<-45;warning('trim limited to 45%')}
> if(par3<0){par3<-0;warning('negative trim makes no sense. Trim is zero.')}
> lotrm<-as.integer(length(y[1,])*par3/100)+1
> hitrm<-as.integer(length(y[1,])*(100-par3)/100)
> y1<-array(dim=c(dim(y)[1], hitrm-lotrm+1), dimnames=list(dimnames(y)[[1]], 1:(hitrm-lotrm+1) ))
> for(i in 1:dim(y)[1]){
+ tmp<-order(y[i,])
+ y1[i,]<- y[i, tmp[lotrm:hitrm] ]
+ }
> postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/1vvpf1288032014.ps",horizontal=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) 
> pairs(t(y))
> dev.off()
null device 
          1 
> y<-y1
> z <- as.data.frame(t(y))
> postscript(file="/var/www/html/rcomp/tmp/2656i1288032014.ps",horizontal=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) 
> (r<-boxplot(z ,xlab=xlab,ylab=ylab,main=main,notch=par2,col=par1))
$stats
      [,1]  [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
[1,]  58.0  69.0   62   67   63   73
[2,]  82.0  86.0   81   84   83   83
[3,]  88.5  90.0   91   90   92   90
[4,]  98.0  99.5   98   98   99   96
[5,] 117.0 113.0  114  111  119  107

$n
[1] 162 104 162 104 162 103

$conf
         [,1]     [,2]     [,3]     [,4]     [,5]     [,6]
[1,] 86.51382 87.90842 88.88968 87.83096 90.01382 87.97613
[2,] 90.48618 92.09158 93.11032 92.16904 93.98618 92.02387

$out
numeric(0)

$group
numeric(0)

$names
[1] "WJ7ARD"  "WJ10ARD" "WJ7AMA"  "WJ10AMA" "WJ7AKN"  "WJ10AKN"

> dev.off()
null device 
          1 
> 
> #Note: the /var/www/html/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/www/html/rcomp/createtable")
> 
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/overview.htm','Boxplot statistics','Boxplot overview'),6,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_whisker.htm','lower whisker','definition of lower whisker'),1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_hinge.htm','lower hinge','definition of lower hinge'),1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/central_tendency.htm','median','definitions about measures of central tendency'),1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_hinge.htm','upper hinge','definition of upper hinge'),1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_whisker.htm','upper whisker','definition of upper whisker'),1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:length(y[,1]))
+ {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE)
+ for (j in 1:5)
+ {
+ a<-table.element(a,round(r$stats[j,i], digits=2))
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/3r5mo1288032014.tab") 
> if (par2){
+ a<-table.start()
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,'Boxplot Notches',4,TRUE)
+ a<-table.row.end(a)
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE)
+ a<-table.element(a,'lower bound',1,TRUE)
+ a<-table.element(a,'median',1,TRUE)
+ a<-table.element(a,'upper bound',1,TRUE)
+ a<-table.row.end(a)
+ for (i in 1:length(y[,1]))
+ {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE)
+ a<-table.element(a,round(r$conf[1,i], digits=2))
+ a<-table.element(a, round(r$stats[3,i], digits=2))
+ a<-table.element(a,round(r$conf[2,i], digits=2))
+ a<-table.row.end(a)
+ }
+ a<-table.end(a)
+ table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/4volu1288032014.tab") 
+ }
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Boxplot Means',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/trimmed_mean.htm','trimmed mean','definition of trimmed mean'),1,TRUE)
> a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/unbiased1.htm','unbiased SD','definition of unbiased SD'),1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:length(y[,1]))
+ {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE)
+ a<-table.element(a,round(mean(z[i], trim=par3/100, na.rm=TRUE), digits=2))
+ a<-table.element(a,round(sd(z[i], na.rm=TRUE), digits=2))
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/html/rcomp/tmp/5nf2x1288032014.tab") 
> try(system("convert tmp/1vvpf1288032014.ps tmp/1vvpf1288032014.png",intern=TRUE))
character(0)
> try(system("convert tmp/2656i1288032014.ps tmp/2656i1288032014.png",intern=TRUE))
character(0)
> 
> 
> proc.time()
   user  system elapsed 
  0.930   0.515  23.111