R version 2.13.0 (2011-04-13) Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: i486-pc-linux-gnu (32-bit) R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(79 + ,30 + ,112285 + ,0 + ,3 + ,4 + ,58 + ,28 + ,84786 + ,0 + ,NA + ,NA + ,60 + ,38 + ,83123 + ,1 + ,1 + ,2 + ,108 + ,30 + ,101193 + ,NA + ,NA + ,NA + ,49 + ,22 + ,38361 + ,NA + ,NA + ,NA + ,0 + ,26 + ,68504 + ,NA + ,NA + ,NA + ,121 + ,25 + ,119182 + ,0 + ,2 + ,4 + ,1 + ,18 + ,22807 + ,NA + ,NA + ,NA + ,20 + ,11 + ,17140 + ,NA + ,NA + ,NA + ,43 + ,26 + ,116174 + ,0 + ,1 + ,4 + ,69 + ,25 + ,57635 + ,1 + ,2 + ,4 + ,78 + ,38 + ,66198 + ,1 + ,1 + ,5 + ,86 + ,44 + ,71701 + ,NA + ,NA + ,NA + ,44 + ,30 + ,57793 + ,1 + ,2 + ,4 + ,104 + ,40 + ,80444 + ,NA + ,NA + ,NA + ,63 + ,34 + ,53855 + ,NA + ,NA + ,NA + ,158 + ,47 + ,97668 + ,1 + ,1 + ,2 + ,102 + ,30 + ,133824 + ,0 + ,4 + ,2 + ,77 + ,31 + ,101481 + ,1 + ,2 + ,4 + ,82 + ,23 + ,99645 + ,0 + ,NA + ,NA + ,115 + ,36 + ,114789 + ,NA + ,NA + ,NA + ,101 + ,36 + ,99052 + ,0 + ,1 + ,4 + ,80 + ,30 + ,67654 + ,1 + ,1 + ,5 + ,50 + ,25 + ,65553 + ,0 + ,NA + ,NA + ,83 + ,39 + ,97500 + ,NA + ,NA + ,NA + ,123 + ,34 + ,69112 + ,1 + ,1 + ,4 + ,73 + ,31 + ,82753 + ,1 + ,2 + ,4 + ,81 + ,31 + ,85323 + ,0 + ,4 + ,5 + ,105 + ,33 + ,72654 + ,1 + ,2 + ,4 + ,47 + ,25 + ,30727 + ,1 + ,2 + ,4 + ,105 + ,33 + ,77873 + ,NA + ,NA + ,NA + ,94 + ,35 + ,117478 + ,0 + ,3 + ,3 + ,44 + ,42 + ,74007 + ,0 + ,2 + ,3 + ,114 + ,43 + ,90183 + ,NA + ,NA + ,NA + ,38 + ,30 + ,61542 + ,NA + ,NA + ,NA + ,107 + ,33 + ,101494 + ,0 + ,2 + ,5 + ,30 + ,13 + ,27570 + ,NA + ,NA + ,NA + ,71 + ,32 + ,55813 + ,NA + ,NA + ,NA + ,84 + ,36 + ,79215 + ,1 + ,3 + ,4 + ,0 + ,0 + ,1423 + ,1 + ,2 + ,4 + ,59 + ,28 + ,55461 + ,NA + ,NA + ,NA + ,33 + ,14 + ,31081 + ,0 + ,4 + ,2 + ,42 + ,17 + ,22996 + ,0 + ,4 + ,4 + ,96 + ,32 + ,83122 + ,1 + ,0 + ,5 + ,106 + ,30 + ,70106 + ,NA + ,NA + ,NA + ,56 + ,35 + ,60578 + ,0 + ,3 + ,3 + ,57 + ,20 + ,39992 + ,1 + ,1 + ,3 + ,59 + ,28 + ,79892 + ,0 + ,1 + ,4 + ,39 + ,28 + ,49810 + ,1 + ,1 + ,5 + ,34 + ,39 + ,71570 + ,NA + ,NA + ,NA + ,76 + ,34 + ,100708 + ,1 + ,2 + ,4 + ,20 + ,26 + ,33032 + ,NA + ,NA + ,NA + ,91 + ,39 + ,82875 + ,0 + ,3 + ,4 + ,115 + ,39 + ,139077 + ,NA + ,NA + ,NA + ,85 + ,33 + ,71595 + ,NA + ,NA + ,NA + ,76 + ,28 + ,72260 + ,1 + ,NA + ,NA + ,8 + ,4 + ,5950 + ,1 + ,NA + ,NA + ,79 + ,39 + ,115762 + ,1 + ,1 + ,4 + ,21 + ,18 + ,32551 + ,NA + ,NA + ,NA + ,30 + ,14 + ,31701 + ,NA + ,NA + ,NA + ,76 + ,29 + ,80670 + ,1 + ,3 + ,3 + ,101 + ,44 + ,143558 + ,1 + ,1 + ,4 + ,94 + ,21 + ,117105 + ,1 + ,2 + ,3 + ,27 + ,16 + ,23789 + ,0 + ,2 + ,4 + ,92 + ,28 + ,120733 + ,NA + ,NA + ,NA + ,123 + ,35 + ,105195 + ,1 + ,2 + ,4 + ,75 + ,28 + ,73107 + ,NA + ,NA + ,NA + ,128 + ,38 + ,132068 + ,NA + ,NA + ,NA + ,105 + ,23 + ,149193 + ,0 + ,NA + ,NA + ,55 + ,36 + ,46821 + ,NA + ,NA + ,NA + ,56 + ,32 + ,87011 + ,NA + ,NA + ,NA + ,41 + ,29 + ,95260 + ,1 + ,1 + ,4 + ,72 + ,25 + ,55183 + ,1 + ,NA + ,NA + ,67 + ,27 + ,106671 + ,0 + ,1 + ,5 + ,75 + ,36 + ,73511 + ,1 + ,NA + ,NA + ,114 + ,28 + ,92945 + ,0 + ,2 + ,4 + ,118 + ,23 + ,78664 + ,NA + ,NA + ,NA + ,77 + ,40 + ,70054 + ,NA + ,NA + ,NA + ,22 + ,23 + ,22618 + ,1 + ,1 + ,3 + ,66 + ,40 + ,74011 + ,NA + ,NA + ,NA + ,69 + ,28 + ,83737 + ,0 + ,1 + ,2 + ,105 + ,34 + ,69094 + ,0 + ,4 + ,4 + ,116 + ,33 + ,93133 + ,NA + ,NA + ,NA + ,88 + ,28 + ,95536 + ,0 + ,3 + ,4 + ,73 + ,34 + ,225920 + ,1 + ,NA + ,NA + ,99 + ,30 + ,62133 + ,NA + ,NA + ,NA + ,62 + ,33 + ,61370 + ,1 + ,1 + ,4 + ,53 + ,22 + ,43836 + ,NA + ,NA + ,NA + ,118 + ,38 + ,106117 + ,1 + ,3 + ,5 + ,30 + ,26 + ,38692 + ,NA + ,NA + ,NA + ,100 + ,35 + ,84651 + ,1 + ,2 + ,5 + ,49 + ,8 + ,56622 + ,NA + ,NA + ,NA + ,24 + ,24 + ,15986 + ,1 + ,1 + ,2 + ,67 + ,29 + ,95364 + ,0 + ,3 + ,1 + ,46 + ,20 + ,26706 + ,1 + ,3 + ,4 + ,57 + ,29 + ,89691 + ,1 + ,1 + ,4 + ,75 + ,45 + ,67267 + ,NA + ,NA + ,NA + ,135 + ,37 + ,126846 + ,1 + ,3 + ,4 + ,68 + ,33 + ,41140 + ,NA + ,NA + ,NA + ,124 + ,33 + ,102860 + ,0 + ,2 + ,1 + ,33 + ,25 + ,51715 + ,1 + ,1 + ,4 + ,98 + ,32 + ,55801 + ,1 + ,2 + ,4 + ,58 + ,29 + ,111813 + ,1 + ,1 + ,2 + ,68 + ,28 + ,120293 + ,1 + ,2 + ,4 + ,81 + ,28 + ,138599 + ,NA + ,NA + ,NA + ,131 + ,31 + ,161647 + ,1 + ,2 + ,5 + ,110 + ,52 + ,115929 + ,0 + ,1 + ,3 + ,37 + ,21 + ,24266 + ,1 + ,3 + ,4 + ,130 + ,24 + ,162901 + ,0 + ,NA + ,NA + ,93 + ,41 + ,109825 + ,0 + ,3 + ,2 + ,118 + ,33 + ,129838 + ,1 + ,4 + ,5 + ,39 + ,32 + ,37510 + ,0 + ,NA + ,NA + ,13 + ,19 + ,43750 + ,NA + ,NA + ,NA + ,74 + ,20 + ,40652 + ,NA + ,NA + ,NA + ,81 + ,31 + ,87771 + ,1 + ,3 + ,4 + ,109 + ,31 + ,85872 + ,NA + ,NA + ,NA + ,151 + ,32 + ,89275 + ,NA + ,NA + ,NA + ,51 + ,18 + ,44418 + ,1 + ,3 + ,4 + ,28 + ,23 + ,192565 + ,0 + ,2 + ,2 + ,40 + ,17 + ,35232 + ,1 + ,3 + ,3 + ,56 + ,20 + ,40909 + ,1 + ,3 + ,4 + ,27 + ,12 + ,13294 + ,1 + ,1 + ,2 + ,37 + ,17 + ,32387 + ,NA + ,NA + ,NA + ,83 + ,30 + ,140867 + ,1 + ,1 + ,4 + ,54 + ,31 + ,120662 + ,NA + ,NA + ,NA + ,27 + ,10 + ,21233 + ,NA + ,NA + ,NA + ,28 + ,13 + ,44332 + ,0 + ,3 + ,3 + ,59 + ,22 + ,61056 + ,1 + ,3 + ,4 + ,133 + ,42 + ,101338 + ,1 + ,1 + ,4 + ,12 + ,1 + ,1168 + ,1 + ,3 + ,2 + ,0 + ,9 + ,13497 + ,NA + ,NA + ,NA + ,106 + ,32 + ,65567 + ,1 + ,1 + ,4 + ,23 + ,11 + ,25162 + ,NA + ,NA + ,NA + ,44 + ,25 + ,32334 + ,0 + ,4 + ,2 + ,71 + ,36 + ,40735 + ,1 + ,3 + ,5 + ,116 + ,31 + ,91413 + ,0 + ,3 + ,4 + ,4 + ,0 + ,855 + ,1 + ,NA + ,NA + ,62 + ,24 + ,97068 + ,1 + ,NA + ,NA + ,12 + ,13 + ,44339 + ,0 + ,4 + ,3 + ,18 + ,8 + ,14116 + ,0 + ,NA + ,NA + ,14 + ,13 + ,10288 + ,1 + ,3 + ,3 + ,60 + ,19 + ,65622 + ,1 + ,1 + ,4 + ,7 + ,18 + ,16563 + ,NA + ,NA + ,NA + ,98 + ,33 + ,76643 + ,1 + ,3 + ,4 + ,64 + ,40 + ,110681 + ,NA + ,NA + ,NA + ,29 + ,22 + ,29011 + ,NA + ,NA + ,NA + ,32 + ,38 + ,92696 + ,0 + ,1 + ,4 + ,25 + ,24 + ,94785 + ,0 + ,4 + ,3 + ,16 + ,8 + ,8773 + ,NA + ,NA + ,NA + ,48 + ,35 + ,83209 + ,NA + ,NA + ,NA + ,100 + ,43 + ,93815 + ,1 + ,2 + ,4 + ,46 + ,43 + ,86687 + ,NA + ,2 + ,2 + ,45 + ,14 + ,34553 + ,1 + ,1 + ,4 + ,129 + ,41 + ,105547 + ,0 + ,3 + ,4 + ,130 + ,38 + ,103487 + ,NA + ,NA + ,NA + ,136 + ,45 + ,213688 + ,1 + ,4 + ,2 + ,59 + ,31 + ,71220 + ,0 + ,NA + ,NA + ,25 + ,13 + ,23517 + ,NA + ,NA + ,NA + ,32 + ,28 + ,56926 + ,NA + ,NA + ,NA + ,63 + ,31 + ,91721 + ,1 + ,2 + ,2 + ,95 + ,40 + ,115168 + ,NA + ,NA + ,NA + ,14 + ,30 + ,111194 + ,1 + ,NA + ,NA + ,36 + ,16 + ,51009 + ,0 + ,2 + ,4 + ,113 + ,37 + ,135777 + ,0 + ,3 + ,4 + ,47 + ,30 + ,51513 + ,0 + ,2 + ,4 + ,92 + ,35 + ,74163 + ,0 + ,4 + ,3 + ,70 + ,32 + ,51633 + ,NA + ,NA + ,NA + ,19 + ,27 + ,75345 + ,NA + ,NA + ,NA + ,50 + ,20 + ,33416 + ,0 + ,3 + ,2 + ,41 + ,18 + ,83305 + ,1 + ,1 + ,3 + ,91 + ,31 + ,98952 + ,1 + ,NA + ,NA + ,111 + ,31 + ,102372 + ,0 + ,1 + ,1 + ,41 + ,21 + ,37238 + ,1 + ,3 + ,4 + ,120 + ,39 + ,103772 + ,0 + ,1 + ,3 + ,135 + ,41 + ,123969 + ,NA + ,NA + ,NA + ,27 + ,13 + ,27142 + ,NA + ,NA + ,NA + ,87 + ,32 + ,135400 + ,NA + ,NA + ,NA + ,25 + ,18 + ,21399 + ,1 + ,3 + ,4 + ,131 + ,39 + ,130115 + ,0 + ,1 + ,4 + ,45 + ,14 + ,24874 + ,0 + ,1 + ,3 + ,29 + ,7 + ,34988 + ,1 + ,1 + ,5 + ,58 + ,17 + ,45549 + ,0 + ,4 + ,5 + ,4 + ,0 + ,6023 + ,NA + ,NA + ,NA + ,47 + ,30 + ,64466 + ,1 + ,1 + ,4 + ,109 + ,37 + ,54990 + ,1 + ,2 + ,4 + ,7 + ,0 + ,1644 + ,NA + ,NA + ,NA + ,12 + ,5 + ,6179 + ,NA + ,NA + ,NA + ,0 + ,1 + ,3926 + ,NA + ,NA + ,NA + ,37 + ,16 + ,32755 + ,NA + ,NA + ,NA + ,37 + ,32 + ,34777 + ,1 + ,1 + ,2 + ,46 + ,24 + ,73224 + ,NA + ,NA + ,NA + ,15 + ,17 + ,27114 + ,0 + ,2 + ,4 + ,42 + ,11 + ,20760 + ,NA + ,NA + ,NA + ,7 + ,24 + ,37636 + ,0 + ,4 + ,4 + ,54 + ,22 + ,65461 + ,1 + ,2 + ,4 + ,54 + ,12 + ,30080 + ,0 + ,1 + ,4 + ,14 + ,19 + ,24094 + ,1 + ,2 + ,3 + ,16 + ,13 + ,69008 + ,1 + ,2 + ,4 + ,33 + ,17 + ,54968 + ,NA + ,NA + ,NA + ,32 + ,15 + ,46090 + ,1 + ,NA + ,NA + ,21 + ,16 + ,27507 + ,NA + ,NA + ,NA + ,15 + ,24 + ,10672 + ,NA + ,NA + ,NA + ,38 + ,15 + ,34029 + ,0 + ,3 + ,2 + ,22 + ,17 + ,46300 + ,0 + ,2 + ,3 + ,28 + ,18 + ,24760 + ,NA + ,NA + ,NA + ,10 + ,20 + ,18779 + ,NA + ,NA + ,NA + ,31 + ,16 + ,21280 + ,NA + ,NA + ,NA + ,32 + ,16 + ,40662 + ,1 + ,1 + ,4 + ,32 + ,18 + ,28987 + ,1 + ,1 + ,4 + ,43 + ,22 + ,22827 + ,NA + ,NA + ,NA + ,27 + ,8 + ,18513 + ,NA + ,NA + ,NA + ,37 + ,17 + ,30594 + ,0 + ,1 + ,2 + ,20 + ,18 + ,24006 + ,NA + ,NA + ,NA + ,32 + ,16 + ,27913 + ,0 + ,2 + ,4 + ,0 + ,23 + ,42744 + ,0 + ,1 + ,4 + ,5 + ,22 + ,12934 + ,0 + ,4 + ,4 + ,26 + ,13 + ,22574 + ,NA + ,NA + ,NA + ,10 + ,13 + ,41385 + ,1 + ,1 + ,2 + ,27 + ,16 + ,18653 + ,1 + ,NA + ,NA + ,11 + ,16 + ,18472 + ,NA + ,NA + ,NA + ,29 + ,20 + ,30976 + ,1 + ,4 + ,4 + ,25 + ,22 + ,63339 + ,1 + ,1 + ,5 + ,55 + ,17 + ,25568 + ,0 + ,3 + ,3 + ,23 + ,18 + ,33747 + ,NA + ,NA + ,NA + ,5 + ,17 + ,4154 + ,1 + ,NA + ,NA + ,43 + ,12 + ,19474 + ,0 + ,NA + ,NA + ,23 + ,7 + ,35130 + ,NA + ,NA + ,NA + ,34 + ,17 + ,39067 + ,1 + ,2 + ,4 + ,36 + ,14 + ,13310 + ,NA + ,NA + ,NA + ,35 + ,23 + ,65892 + ,1 + ,3 + ,5 + ,0 + ,17 + ,4143 + ,0 + ,2 + ,4 + ,37 + ,14 + ,28579 + ,1 + ,3 + ,4 + ,28 + ,15 + ,51776 + ,NA + ,NA + ,NA + ,16 + ,17 + ,21152 + ,NA + ,NA + ,NA + ,26 + ,21 + ,38084 + ,1 + ,2 + ,4 + ,38 + ,18 + ,27717 + ,1 + ,2 + ,4 + ,23 + ,18 + ,32928 + ,1 + ,1 + ,2 + ,22 + ,17 + ,11342 + ,NA + ,NA + ,NA + ,30 + ,17 + ,19499 + ,1 + ,1 + ,4 + ,16 + ,16 + ,16380 + ,NA + ,NA + ,NA + ,18 + ,15 + ,36874 + ,1 + ,NA + ,NA + ,28 + ,21 + ,48259 + ,1 + ,NA + ,NA + ,32 + ,16 + ,16734 + ,NA + ,NA + ,NA + ,21 + ,14 + ,28207 + ,0 + ,1 + ,2 + ,23 + ,15 + ,30143 + ,NA + ,NA + ,NA + ,29 + ,17 + ,41369 + ,NA + ,NA + ,NA + ,50 + ,15 + ,45833 + ,0 + ,2 + ,4 + ,12 + ,15 + ,29156 + ,1 + ,1 + ,5 + ,21 + ,10 + ,35944 + ,NA + ,NA + ,NA + ,18 + ,6 + ,36278 + ,NA + ,NA + ,NA + ,27 + ,22 + ,45588 + ,1 + ,3 + ,4 + ,41 + ,21 + ,45097 + ,1 + ,3 + ,3 + ,13 + ,1 + ,3895 + ,NA + ,NA + ,NA + ,12 + ,18 + ,28394 + ,0 + ,2 + ,4 + ,21 + ,17 + ,18632 + ,0 + ,3 + ,2 + ,8 + ,4 + ,2325 + ,0 + ,4 + ,4 + ,26 + ,10 + ,25139 + ,1 + ,3 + ,5 + ,27 + ,16 + ,27975 + ,1 + ,NA + ,NA + ,13 + ,16 + ,14483 + ,NA + ,NA + ,NA + ,16 + ,9 + ,13127 + ,NA + ,NA + ,NA + ,2 + ,16 + ,5839 + ,NA + ,NA + ,NA + ,42 + ,17 + ,24069 + ,NA + ,NA + ,NA + ,5 + ,7 + ,3738 + ,NA + ,NA + ,NA + ,37 + ,15 + ,18625 + ,NA + ,3 + ,4 + ,17 + ,14 + ,36341 + ,NA + ,NA + ,NA + ,38 + ,14 + ,24548 + ,NA + ,NA + ,NA + ,37 + ,18 + ,21792 + ,0 + ,2 + ,4 + ,29 + ,12 + ,26263 + ,0 + ,2 + ,2 + ,32 + ,16 + ,23686 + ,0 + ,1 + ,2 + ,35 + ,21 + ,49303 + ,0 + ,NA + ,NA + ,17 + ,19 + ,25659 + ,NA + ,NA + ,NA + ,20 + ,16 + ,28904 + ,NA + ,NA + ,NA + ,7 + ,1 + ,2781 + ,NA + ,NA + ,NA + ,46 + ,16 + ,29236 + ,NA + ,NA + ,NA + ,24 + ,10 + ,19546 + ,NA + ,NA + ,NA + ,40 + ,19 + ,22818 + ,NA + ,NA + ,NA + ,3 + ,12 + ,32689 + ,NA + ,NA + ,NA + ,10 + ,2 + ,5752 + ,1 + ,NA + ,NA + ,37 + ,14 + ,22197 + ,NA + ,NA + ,NA + ,17 + ,17 + ,20055 + ,0 + ,2 + ,4 + ,28 + ,19 + ,25272 + ,NA + ,NA + ,NA + ,19 + ,14 + ,82206 + ,NA + ,NA + ,NA + ,29 + ,11 + ,32073 + ,NA + ,NA + ,NA + ,8 + ,4 + ,5444 + ,NA + ,NA + ,NA + ,10 + ,16 + ,20154 + ,1 + ,2 + ,4 + ,15 + ,20 + ,36944 + ,NA + ,NA + ,NA + ,15 + ,12 + ,8019 + ,NA + ,NA + ,NA + ,28 + ,15 + ,30884 + ,NA + ,NA + ,NA + ,17 + ,16 + ,19540 + ,1 + ,NA + ,NA) + ,dim=c(6 + ,289) + ,dimnames=list(c('blogged_computations' + ,'compendiums_reviewed' + ,'totsize' + ,'Gender' + ,'Restless' + ,'Software') + ,1:289)) > y <- array(NA,dim=c(6,289),dimnames=list(c('blogged_computations','compendiums_reviewed','totsize','Gender','Restless','Software'),1:289)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par1 = 'kendall' > main = 'Correlation Matrix' > panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor) + { + usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) + par(usr = c(0, 1, 0, 1)) + rr <- cor.test(x, y, method=par1) + r <- round(rr$p.value,2) + txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1] + txt <- paste(prefix, txt, sep='') + if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt) + text(0.5, 0.5, txt, cex = cex) + } > panel.hist <- function(x, ...) + { + usr <- par('usr'); on.exit(par(usr)) + par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) ) + h <- hist(x, plot = FALSE) + breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks) + y <- h$counts; y <- y/max(y) + rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...) + } > postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/11lcz1323957076.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main) > dev.off() null device 1 > > #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") > > n <- length(y[,1]) > n [1] 6 > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,paste('Correlations for all pairs of data series (method=',par1,')',sep=''),n+1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,' ',header=TRUE) > for (i in 1:n) { + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) + } > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:n) { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE) + for (j in 1:n) { + r <- cor.test(y[i,],y[j,],method=par1) + a<-table.element(a,round(r$estimate,3)) + } + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2erpb1323957076.tab") > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Correlations for all pairs of data series with p-values',4,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'pair',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Pearson r',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Spearman rho',1,TRUE) > a<-table.element(a,'Kendall tau',1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > cor.test(y[1,],y[2,],method=par1) Kendall's rank correlation tau data: y[1, ] and y[2, ] z = 14.2906, p-value < 2.2e-16 alternative hypothesis: true tau is not equal to 0 sample estimates: tau 0.5740119 > for (i in 1:(n-1)) + { + for (j in (i+1):n) + { + a<-table.row.start(a) + dum <- paste(dimnames(t(x))[[2]][i],';',dimnames(t(x))[[2]][j],sep='') + a<-table.element(a,dum,header=TRUE) + rp <- cor.test(y[i,],y[j,],method='pearson') + a<-table.element(a,round(rp$estimate,4)) + rs <- cor.test(y[i,],y[j,],method='spearman') + a<-table.element(a,round(rs$estimate,4)) + rk <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall') + a<-table.element(a,round(rk$estimate,4)) + a<-table.row.end(a) + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,'p-value',header=T) + a<-table.element(a,paste('(',round(rp$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.element(a,paste('(',round(rs$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.element(a,paste('(',round(rk$p.value,4),')',sep='')) + a<-table.row.end(a) + } + } There were 15 warnings (use warnings() to see them) > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/30pww1323957076.tab") > > try(system("convert tmp/11lcz1323957076.ps tmp/11lcz1323957076.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 1.910 0.096 2.000