R version 2.13.0 (2011-04-13)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i486-pc-linux-gnu (32-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
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Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
> x <- array(list(1
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+ ,dim=c(6
+ ,146)
+ ,dimnames=list(c('I_felt_depressed'
+ ,'I_felt_sad'
+ ,'everything_was_effort'
+ ,'trouble_mind'
+ ,'I_enjoyed_life'
+ ,'sleep_restless')
+ ,1:146))
> y <- array(NA,dim=c(6,146),dimnames=list(c('I_felt_depressed','I_felt_sad','everything_was_effort','trouble_mind','I_enjoyed_life','sleep_restless'),1:146))
> for (i in 1:dim(x)[1])
+ {
+ for (j in 1:dim(x)[2])
+ {
+ y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
+ }
+ }
> par1 = '1 2 3 4 5'
> #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.0.44 ()
> #Author: Dr. Ian E. Holliday
> #To cite this work: Ian E. Holliday, 2009, YOUR SOFTWARE TITLE (vNUMBER) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/rwasp_YOURPAGE.wasp/
> #Source of accompanying publication:
> #Technical description:
> docor <- function(x,y,method) {
+ r <- cor.test(x,y,method=method)
+ paste(round(r$estimate,3),' (',round(r$p.value,3),')',sep='')
+ }
> x <- t(x)
> nx <- length(x[,1])
> cx <- length(x[1,])
> mymedian <- median(as.numeric(strsplit(par1,' ')[[1]]))
> myresult <- array(NA, dim = c(cx,7))
> rownames(myresult) <- paste('Q',1:cx,sep='')
> colnames(myresult) <- c('mean','Sum of
positives (Ps)','Sum of
negatives (Ns)', '(Ps-Ns)/(Ps+Ns)', 'Count of
positives (Pc)', 'Count of
negatives (Nc)', '(Pc-Nc)/(Pc+Nc)')
> for (i in 1:cx) {
+ spos <- 0
+ sneg <- 0
+ cpos <- 0
+ cneg <- 0
+ for (j in 1:nx) {
+ if (!is.na(x[j,i])) {
+ myx <- as.numeric(x[j,i]) - mymedian
+ if (myx > 0) {
+ spos = spos + myx
+ cpos = cpos + 1
+ }
+ if (myx < 0) {
+ sneg = sneg + abs(myx)
+ cneg = cneg + 1
+ }
+ }
+ }
+ myresult[i,1] <- round(mean(as.numeric(x[,i]),na.rm=T)-mymedian,2)
+ myresult[i,2] <- spos
+ myresult[i,3] <- sneg
+ myresult[i,4] <- round((spos - sneg) / (spos + sneg),2)
+ myresult[i,5] <- cpos
+ myresult[i,6] <- cneg
+ myresult[i,7] <- round((cpos - cneg) / (cpos + cneg),2)
+ }
> myresult
mean Sum of
positives (Ps) Sum of
negatives (Ns) (Ps-Ns)/(Ps+Ns)
Q1 -1.50 5 224 -0.96
Q2 -1.12 5 169 -0.94
Q3 -0.86 10 135 -0.86
Q4 -0.74 15 123 -0.78
Q5 0.15 55 33 0.25
Q6 -0.86 16 141 -0.80
Count of
positives (Pc) Count of
negatives (Nc) (Pc-Nc)/(Pc+Nc)
Q1 5 127 -0.92
Q2 5 120 -0.92
Q3 10 101 -0.82
Q4 15 87 -0.71
Q5 55 26 0.36
Q6 16 92 -0.70
>
> #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable")
>
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Summary of survey scores (median of Likert score was subtracted)',8,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Question',header=TRUE)
> for (i in 1:7) {
+ a<-table.element(a,colnames(myresult)[i],header=TRUE)
+ }
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:cx) {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,i,header=TRUE)
+ for (j in 1:7) {
+ a<-table.element(a,myresult[i,j],align='right')
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1v0q81324130713.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Pearson correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2dwk41324130713.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Kendall tau rank correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3d9p61324130713.tab")
>
>
>
> proc.time()
user system elapsed
0.447 0.035 0.474