x <- array(list(41 ,14 ,39 ,18 ,30 ,11 ,31 ,12 ,34 ,16 ,35 ,18 ,39 ,14 ,34 ,14 ,36 ,15 ,37 ,15 ,38 ,17 ,36 ,19 ,38 ,10 ,39 ,16 ,33 ,18 ,32 ,14 ,36 ,14 ,38 ,17 ,39 ,14 ,32 ,16 ,32 ,18 ,31 ,11 ,39 ,14 ,37 ,12 ,39 ,17 ,41 ,9 ,36 ,16 ,33 ,14 ,33 ,15 ,34 ,11 ,31 ,16 ,27 ,13 ,37 ,17 ,34 ,15 ,34 ,14 ,32 ,16 ,29 ,9 ,36 ,15 ,29 ,17 ,35 ,13 ,37 ,15 ,34 ,16 ,38 ,16 ,35 ,12 ,38 ,12 ,37 ,11 ,38 ,15 ,33 ,15 ,36 ,17 ,38 ,13 ,32 ,16 ,32 ,14 ,32 ,11 ,34 ,12 ,32 ,12 ,37 ,15 ,39 ,16 ,29 ,15 ,37 ,12 ,35 ,12 ,30 ,8 ,38 ,13 ,34 ,11 ,31 ,14 ,34 ,15 ,35 ,10 ,36 ,11 ,30 ,12 ,39 ,15 ,35 ,15 ,38 ,14 ,31 ,16 ,34 ,15 ,38 ,15 ,34 ,13 ,39 ,12 ,37 ,17 ,34 ,13 ,28 ,15 ,37 ,13 ,33 ,15 ,37 ,16 ,35 ,15 ,37 ,16 ,32 ,15 ,33 ,14 ,38 ,15 ,33 ,14 ,29 ,13 ,33 ,7 ,31 ,17 ,36 ,13 ,35 ,15 ,32 ,14 ,29 ,13 ,39 ,16 ,37 ,12 ,35 ,14 ,37 ,17 ,32 ,15 ,38 ,17 ,37 ,12 ,36 ,16 ,32 ,11 ,33 ,15 ,40 ,9 ,38 ,16 ,41 ,15 ,36 ,10 ,43 ,10 ,30 ,15 ,31 ,11 ,32 ,13 ,32 ,14 ,37 ,18 ,37 ,16 ,33 ,14 ,34 ,14 ,33 ,14 ,38 ,14 ,33 ,12 ,31 ,14 ,38 ,15 ,37 ,15 ,33 ,15 ,31 ,13 ,39 ,17 ,44 ,17 ,33 ,19 ,35 ,15 ,32 ,13 ,28 ,9 ,40 ,15 ,27 ,15 ,37 ,15 ,32 ,16 ,28 ,11 ,34 ,14 ,30 ,11 ,35 ,15 ,31 ,13 ,32 ,15 ,30 ,16 ,30 ,14 ,31 ,15 ,40 ,16 ,32 ,16 ,36 ,11 ,32 ,12 ,35 ,9 ,38 ,16 ,42 ,13 ,34 ,16 ,35 ,12 ,35 ,9 ,33 ,13 ,36 ,13 ,32 ,14 ,33 ,19 ,34 ,13 ,32 ,12 ,34 ,13) ,dim=c(2 ,162) ,dimnames=list(c('Connected' ,'Happiness') ,1:162)) y <- array(NA,dim=c(2,162),dimnames=list(c('Connected','Happiness'),1:162)) for (i in 1:dim(x)[1]) { for (j in 1:dim(x)[2]) { y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) } } par20 = '' par19 = '' par18 = '' par17 = '' par16 = '' par15 = '' par14 = '' par13 = '' par12 = '' par11 = '' par10 = '' par9 = '' par8 = '' par7 = '' par6 = '' par5 = '' par4 = '' par3 = 'Pearson Chi-Squared' par2 = '2' par1 = '1' main = 'Association Plot' library(vcd) cat1 <- as.numeric(par1) # cat2<- as.numeric(par2) # simulate.p.value=FALSE if (par3 == 'Exact Pearson Chi-Squared by Simulation') simulate.p.value=TRUE x <- t(x) (z <- array(unlist(x),dim=c(length(x[,1]),length(x[1,])))) (table1 <- table(z[,cat1],z[,cat2])) (V1<-dimnames(y)[[1]][cat1]) (V2<-dimnames(y)[[1]][cat2]) postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1hvnf1321101615.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) assoc(ftable(z[,cat1],z[,cat2],row.vars=1,dnn=c(V1,V2)),shade=T) dev.off() #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Tabulation of Results',ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,paste(V1,' x ', V2),ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, ' ', 1,TRUE) for(nc in 1:ncol(table1)){ a<-table.element(a, colnames(table1)[nc], 1, TRUE) } a<-table.row.end(a) for(nr in 1:nrow(table1) ){ a<-table.element(a, rownames(table1)[nr], 1, TRUE) for(nc in 1:ncol(table1) ){ a<-table.element(a, table1[nr, nc], 1, FALSE) } a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2ri031321101615.tab") (cst<-chisq.test(table1, simulate.p.value=simulate.p.value) ) if (par3 == 'McNemar Chi-Squared') { (cst <- mcnemar.test(table1)) } if (par3=='Fisher Exact Test') { (cst <- fisher.test(table1)) } if ((par3 != 'McNemar Chi-Squared') & (par3 != 'Fisher Exact Test')) { a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Tabulation of Expected Results',ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,paste(V1,' x ', V2),ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, ' ', 1,TRUE) for(nc in 1:ncol(table1)){ a<-table.element(a, colnames(table1)[nc], 1, TRUE) } a<-table.row.end(a) for(nr in 1:nrow(table1) ){ a<-table.element(a, rownames(table1)[nr], 1, TRUE) for(nc in 1:ncol(table1) ){ a<-table.element(a, round(cst$expected[nr, nc], digits=2), 1, FALSE) } a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3bzkz1321101615.tab") } a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Statistical Results',2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, cst$method, 2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) if (par3=='Pearson Chi-Squared') a<-table.element(a, 'Pearson Chi Square Statistic', 1, TRUE) if (par3=='Exact Pearson Chi-Squared by Simulation') a<-table.element(a, 'Exact Pearson Chi Square Statistic', 1, TRUE) if (par3=='McNemar Chi-Squared') a<-table.element(a, 'McNemar Chi Square Statistic', 1, TRUE) if (par3=='Fisher Exact Test') a<-table.element(a, 'Odds Ratio', 1, TRUE) if (par3=='Fisher Exact Test') { if ((ncol(table1) == 2) & (nrow(table1) == 2)) { a<-table.element(a, round(cst$estimate, digits=2), 1,FALSE) } else { a<-table.element(a, '--', 1,FALSE) } } else { a<-table.element(a, round(cst$statistic, digits=2), 1,FALSE) } a<-table.row.end(a) if(!simulate.p.value){ if(par3!='Fisher Exact Test') { a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, 'Degrees of Freedom', 1, TRUE) a<-table.element(a, cst$parameter, 1,FALSE) a<-table.row.end(a) } } a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, 'P value', 1, TRUE) a<-table.element(a, round(cst$p.value, digits=2), 1,FALSE) a<-table.row.end(a) a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/42hx71321101615.tab") try(system("convert tmp/1hvnf1321101615.ps tmp/1hvnf1321101615.png",intern=TRUE))