x <- array(list('B' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'C' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'B' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'C' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'C' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'B' ,'HI' ,'B' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'A' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'LO' ,'D' ,'LO' ,'A' ,'HI' ,'C' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'D' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'C' ,'LO' ,'B' ,'HI' ,'A' ,'HI' ,'C' ,'LO' ,'D' ,'HI' ,'C' ,'HI') ,dim=c(2 ,162) ,dimnames=list(c('Happiness' ,'Separate') ,1:162)) y <- array(NA,dim=c(2,162),dimnames=list(c('Happiness','Separate'),1:162)) for (i in 1:dim(x)[1]) { for (j in 1:dim(x)[2]) { y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) } } par3 = 'Pearson Chi-Squared' par2 = '2' par1 = '1' main = 'Association Plot' library(vcd) cat1 <- as.numeric(par1) # cat2<- as.numeric(par2) # simulate.p.value=FALSE if (par3 == 'Exact Pearson Chi-Squared by Simulation') simulate.p.value=TRUE x <- t(x) (z <- array(unlist(x),dim=c(length(x[,1]),length(x[1,])))) (table1 <- table(z[,cat1],z[,cat2])) (V1<-dimnames(y)[[1]][cat1]) (V2<-dimnames(y)[[1]][cat2]) postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1me8l1321112460.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) assoc(ftable(z[,cat1],z[,cat2],row.vars=1,dnn=c(V1,V2)),shade=T) dev.off() #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Tabulation of Results',ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,paste(V1,' x ', V2),ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, ' ', 1,TRUE) for(nc in 1:ncol(table1)){ a<-table.element(a, colnames(table1)[nc], 1, TRUE) } a<-table.row.end(a) for(nr in 1:nrow(table1) ){ a<-table.element(a, rownames(table1)[nr], 1, TRUE) for(nc in 1:ncol(table1) ){ a<-table.element(a, table1[nr, nc], 1, FALSE) } a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/28utw1321112460.tab") (cst<-chisq.test(table1, simulate.p.value=simulate.p.value) ) if (par3 == 'McNemar Chi-Squared') { (cst <- mcnemar.test(table1)) } if (par3 != 'McNemar Chi-Squared') { a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Tabulation of Expected Results',ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,paste(V1,' x ', V2),ncol(table1)+1,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, ' ', 1,TRUE) for(nc in 1:ncol(table1)){ a<-table.element(a, colnames(table1)[nc], 1, TRUE) } a<-table.row.end(a) for(nr in 1:nrow(table1) ){ a<-table.element(a, rownames(table1)[nr], 1, TRUE) for(nc in 1:ncol(table1) ){ a<-table.element(a, round(cst$expected[nr, nc], digits=2), 1, FALSE) } a<-table.row.end(a) } a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/33lhl1321112460.tab") } a<-table.start() a<-table.row.start(a) a<-table.element(a,'Statistical Results',2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, cst$method, 2,TRUE) a<-table.row.end(a) a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, 'Chi Square Statistic', 1, TRUE) a<-table.element(a, round(cst$statistic, digits=2), 1,FALSE) a<-table.row.end(a) if(!simulate.p.value){ a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, 'Degrees of Freedom', 1, TRUE) a<-table.element(a, cst$parameter, 1,FALSE) a<-table.row.end(a) } a<-table.row.start(a) a<-table.element(a, 'P value', 1, TRUE) a<-table.element(a, round(cst$p.value, digits=2), 1,FALSE) a<-table.row.end(a) a<-table.end(a) table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/4jzer1321112460.tab") try(system("convert tmp/1me8l1321112460.ps tmp/1me8l1321112460.png",intern=TRUE))