R version 2.12.1 (2010-12-16)
Copyright (C) 2010 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i486-pc-linux-gnu (32-bit)
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+ ,'A20')
+ ,1:110))
> y <- array(NA,dim=c(20,110),dimnames=list(c('A1','A2','A3','A4','A5','A6','A7','A8','A9','A10','A11','A12','A13','A14','A15','A16','A17','A18','A19','A20'),1:110))
> for (i in 1:dim(x)[1])
+ {
+ for (j in 1:dim(x)[2])
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+ y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
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> par20 = ''
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> par2 = ''
> par1 = '1 2 3 4 5'
> docor <- function(x,y,method) {
+ r <- cor.test(x,y,method=method)
+ paste(round(r$estimate,3),' (',round(r$p.value,3),')',sep='')
+ }
> x <- t(x)
> nx <- length(x[,1])
> cx <- length(x[1,])
> mymedian <- median(as.numeric(strsplit(par1,' ')[[1]]))
> myresult <- array(NA, dim = c(cx,7))
> rownames(myresult) <- paste('Q',1:cx,sep='')
> colnames(myresult) <- c('mean','Sum of
positives (Ps)','Sum of
negatives (Ns)', '(Ps-Ns)/(Ps+Ns)', 'Count of
positives (Pc)', 'Count of
negatives (Nc)', '(Pc-Nc)/(Pc+Nc)')
> for (i in 1:cx) {
+ spos <- 0
+ sneg <- 0
+ cpos <- 0
+ cneg <- 0
+ for (j in 1:nx) {
+ if (!is.na(x[j,i])) {
+ myx <- as.numeric(x[j,i]) - mymedian
+ if (myx > 0) {
+ spos = spos + myx
+ cpos = cpos + 1
+ }
+ if (myx < 0) {
+ sneg = sneg + abs(myx)
+ cneg = cneg + 1
+ }
+ }
+ }
+ myresult[i,1] <- round(mean(as.numeric(x[,i]),na.rm=T)-mymedian,2)
+ myresult[i,2] <- spos
+ myresult[i,3] <- sneg
+ myresult[i,4] <- round((spos - sneg) / (spos + sneg),2)
+ myresult[i,5] <- cpos
+ myresult[i,6] <- cneg
+ myresult[i,7] <- round((cpos - cneg) / (cpos + cneg),2)
+ }
> myresult
mean Sum of
positives (Ps) Sum of
negatives (Ns) (Ps-Ns)/(Ps+Ns)
Q1 0.97 114 7 0.88
Q2 0.08 55 46 0.09
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Q4 -0.12 34 47 -0.16
Q5 0.52 76 19 0.60
Q6 0.87 105 9 0.84
Q7 0.75 92 9 0.82
Q8 0.78 95 9 0.83
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Q11 0.65 85 14 0.72
Q12 0.41 63 18 0.56
Q13 0.47 75 23 0.53
Q14 0.40 70 26 0.46
Q15 0.48 72 19 0.58
Q16 0.21 49 26 0.31
Q17 0.65 82 10 0.78
Q18 0.59 77 12 0.73
Q19 0.34 62 25 0.43
Q20 -0.05 41 46 -0.06
Count of
positives (Pc) Count of
negatives (Nc) (Pc-Nc)/(Pc+Nc)
Q1 93 7 0.86
Q2 43 41 0.02
Q3 83 7 0.84
Q4 27 42 -0.22
Q5 63 15 0.62
Q6 86 9 0.81
Q7 75 8 0.81
Q8 82 9 0.80
Q9 13 68 -0.68
Q10 83 9 0.80
Q11 71 12 0.71
Q12 59 16 0.57
Q13 67 21 0.52
Q14 60 23 0.45
Q15 65 18 0.57
Q16 45 23 0.32
Q17 74 9 0.78
Q18 71 9 0.78
Q19 59 25 0.40
Q20 39 41 -0.02
>
> #Note: the /var/www/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/www/rcomp/createtable")
>
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Summary of survey scores (median of Likert score was subtracted)',8,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Question',header=TRUE)
> for (i in 1:7) {
+ a<-table.element(a,colnames(myresult)[i],header=TRUE)
+ }
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:cx) {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,i,header=TRUE)
+ for (j in 1:7) {
+ a<-table.element(a,myresult[i,j],align='right')
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/rcomp/tmp/1ifhm1318272890.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Pearson correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/rcomp/tmp/2zaj81318272890.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Kendall tau rank correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
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Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
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In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
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In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
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In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor.test.default(x, y, method = method) :
Cannot compute exact p-value with ties
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/www/rcomp/tmp/3okkv1318272890.tab")
>
>
>
> proc.time()
user system elapsed
2.200 0.068 2.253