R version 2.13.0 (2011-04-13)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i486-pc-linux-gnu (32-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
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'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
> x <- array(list(23
+ ,17
+ ,23
+ ,4
+ ,24
+ ,17
+ ,20
+ ,4
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+ ,4
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+ ,8
+ ,24
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+ ,28
+ ,4
+ ,28
+ ,22
+ ,28
+ ,4
+ ,27
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+ ,27
+ ,4
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+ ,8
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+ ,17
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+ ,28
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+ ,14
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+ ,4
+ ,28
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+ ,24
+ ,4
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+ ,5
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+ ,24
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+ ,20
+ ,8
+ ,27
+ ,4
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+ ,4
+ ,24
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+ ,21
+ ,4
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+ ,28
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+ ,4
+ ,26
+ ,23
+ ,22
+ ,4
+ ,26
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+ ,27
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+ ,26
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+ ,26
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+ ,25
+ ,4
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+ ,6
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+ ,18
+ ,8
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+ ,27
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+ ,28
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+ ,26
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+ ,19
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+ ,28
+ ,6
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+ ,24
+ ,18
+ ,4
+ ,28
+ ,25
+ ,25
+ ,4
+ ,28
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+ ,23
+ ,4
+ ,20
+ ,21
+ ,21
+ ,5
+ ,25
+ ,23
+ ,20
+ ,6
+ ,19
+ ,27
+ ,25
+ ,16
+ ,25
+ ,23
+ ,22
+ ,6
+ ,22
+ ,18
+ ,21
+ ,6
+ ,18
+ ,16
+ ,16
+ ,4)
+ ,dim=c(4
+ ,161)
+ ,dimnames=list(c('Q2'
+ ,'Q9'
+ ,'Q16'
+ ,'Q23')
+ ,1:161))
> y <- array(NA,dim=c(4,161),dimnames=list(c('Q2','Q9','Q16','Q23'),1:161))
> for (i in 1:dim(x)[1])
+ {
+ for (j in 1:dim(x)[2])
+ {
+ y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
+ }
+ }
> par1 = '1 2 3 4 5 6 7'
> docor <- function(x,y,method) {
+ r <- cor.test(x,y,method=method)
+ paste(round(r$estimate,3),' (',round(r$p.value,3),')',sep='')
+ }
> x <- t(x)
> nx <- length(x[,1])
> cx <- length(x[1,])
> mymedian <- median(as.numeric(strsplit(par1,' ')[[1]]))
> myresult <- array(NA, dim = c(cx,7))
> rownames(myresult) <- paste('Q',1:cx,sep='')
> colnames(myresult) <- c('mean','Sum of
positives (Ps)','Sum of
negatives (Ns)', '(Ps-Ns)/(Ps+Ns)', 'Count of
positives (Pc)', 'Count of
negatives (Nc)', '(Pc-Nc)/(Pc+Nc)')
> for (i in 1:cx) {
+ spos <- 0
+ sneg <- 0
+ cpos <- 0
+ cneg <- 0
+ for (j in 1:nx) {
+ if (!is.na(x[j,i])) {
+ myx <- as.numeric(x[j,i]) - mymedian
+ if (myx > 0) {
+ spos = spos + myx
+ cpos = cpos + 1
+ }
+ if (myx < 0) {
+ sneg = sneg + abs(myx)
+ cneg = cneg + 1
+ }
+ }
+ }
+ myresult[i,1] <- round(mean(as.numeric(x[,i]),na.rm=T)-mymedian,2)
+ myresult[i,2] <- spos
+ myresult[i,3] <- sneg
+ myresult[i,4] <- round((spos - sneg) / (spos + sneg),2)
+ myresult[i,5] <- cpos
+ myresult[i,6] <- cneg
+ myresult[i,7] <- round((cpos - cneg) / (cpos + cneg),2)
+ }
> myresult
mean Sum of
positives (Ps) Sum of
negatives (Ns) (Ps-Ns)/(Ps+Ns)
Q1 19.06 3068 0 1
Q2 16.59 2671 0 1
Q3 18.42 2966 0 1
Q4 1.81 291 0 1
Count of
positives (Pc) Count of
negatives (Nc) (Pc-Nc)/(Pc+Nc)
Q1 161 0 1
Q2 161 0 1
Q3 161 0 1
Q4 84 0 1
>
> #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable")
>
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Summary of survey scores (median of Likert score was subtracted)',8,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Question',header=TRUE)
> for (i in 1:7) {
+ a<-table.element(a,colnames(myresult)[i],header=TRUE)
+ }
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:cx) {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,i,header=TRUE)
+ for (j in 1:7) {
+ a<-table.element(a,myresult[i,j],align='right')
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1fjir1318661208.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Pearson correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
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In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
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In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='pearson'),align='right')
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In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='pearson'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='pearson'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y) : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2uz5c1318661208.tab")
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Kendall tau rank correlations of survey scores (and p-values)',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'mean',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,1],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Ps-Ns)/(Ps+Ns)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,4],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'(Pc-Nc)/(Pc+Nc)',header=TRUE)
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,1],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,4],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.element(a,docor(myresult[,7],myresult[,7],method='kendall'),align='right')
Warning message:
In cor(x, y, method = "kendall") : the standard deviation is zero
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3qalk1318661208.tab")
>
>
>
> proc.time()
user system elapsed
0.325 0.034 0.352