R version 2.15.2 (2012-10-26) -- "Trick or Treat"
Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.

R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.

> x <- array(list(41
+ ,38
+ ,7
+ ,53
+ ,145
+ ,56
+ ,39
+ ,32
+ ,5
+ ,86
+ ,101
+ ,56
+ ,30
+ ,35
+ ,5
+ ,66
+ ,98
+ ,54
+ ,31
+ ,33
+ ,5
+ ,67
+ ,132
+ ,89
+ ,34
+ ,37
+ ,8
+ ,76
+ ,60
+ ,40
+ ,35
+ ,29
+ ,6
+ ,78
+ ,38
+ ,25
+ ,39
+ ,31
+ ,5
+ ,53
+ ,144
+ ,92
+ ,34
+ ,36
+ ,6
+ ,80
+ ,5
+ ,18
+ ,36
+ ,35
+ ,5
+ ,74
+ ,28
+ ,63
+ ,37
+ ,38
+ ,4
+ ,76
+ ,84
+ ,44
+ ,38
+ ,31
+ ,6
+ ,79
+ ,79
+ ,33
+ ,36
+ ,34
+ ,5
+ ,54
+ ,127
+ ,84
+ ,38
+ ,35
+ ,5
+ ,67
+ ,78
+ ,88
+ ,39
+ ,38
+ ,6
+ ,54
+ ,60
+ ,55
+ ,33
+ ,37
+ ,7
+ ,87
+ ,131
+ ,60
+ ,32
+ ,33
+ ,6
+ ,58
+ ,84
+ ,66
+ ,36
+ ,32
+ ,7
+ ,75
+ ,133
+ ,154
+ ,38
+ ,38
+ ,6
+ ,88
+ ,150
+ ,53
+ ,39
+ ,38
+ ,8
+ ,64
+ ,91
+ ,119
+ ,32
+ ,32
+ ,7
+ ,57
+ ,132
+ ,41
+ ,32
+ ,33
+ ,5
+ ,66
+ ,136
+ ,61
+ ,31
+ ,31
+ ,5
+ ,68
+ ,124
+ ,58
+ ,39
+ ,38
+ ,7
+ ,54
+ ,118
+ ,75
+ ,37
+ ,39
+ ,7
+ ,56
+ ,70
+ ,33
+ ,39
+ ,32
+ ,5
+ ,86
+ ,107
+ ,40
+ ,41
+ ,32
+ ,4
+ ,80
+ ,119
+ ,92
+ ,36
+ ,35
+ ,10
+ ,76
+ ,89
+ ,100
+ ,33
+ ,37
+ ,6
+ ,69
+ ,112
+ ,112
+ ,33
+ ,33
+ ,5
+ ,78
+ ,108
+ ,73
+ ,34
+ ,33
+ ,5
+ ,67
+ ,52
+ ,40
+ ,31
+ ,28
+ ,5
+ ,80
+ ,112
+ ,45
+ ,27
+ ,32
+ ,5
+ ,54
+ ,116
+ ,60
+ ,37
+ ,31
+ ,6
+ ,71
+ ,123
+ ,62
+ ,34
+ ,37
+ ,5
+ ,84
+ ,125
+ ,75
+ ,34
+ ,30
+ ,5
+ ,74
+ ,27
+ ,31
+ ,32
+ ,33
+ ,5
+ ,71
+ ,162
+ ,77
+ ,29
+ ,31
+ ,5
+ ,63
+ ,32
+ ,34
+ ,36
+ ,33
+ ,5
+ ,71
+ ,64
+ ,46
+ ,29
+ ,31
+ ,5
+ ,76
+ ,92
+ ,99
+ ,35
+ ,33
+ ,5
+ ,69
+ ,0
+ ,17
+ ,37
+ ,32
+ ,5
+ ,74
+ ,83
+ ,66
+ ,34
+ ,33
+ ,7
+ ,75
+ ,41
+ ,30
+ ,38
+ ,32
+ ,5
+ ,54
+ ,47
+ ,76
+ ,35
+ ,33
+ ,6
+ ,52
+ ,120
+ ,146
+ ,38
+ ,28
+ ,7
+ ,69
+ ,105
+ ,67
+ ,37
+ ,35
+ ,7
+ ,68
+ ,79
+ ,56
+ ,38
+ ,39
+ ,5
+ ,65
+ ,65
+ ,107
+ ,33
+ ,34
+ ,5
+ ,75
+ ,70
+ ,58
+ ,36
+ ,38
+ ,4
+ ,74
+ ,55
+ ,34
+ ,38
+ ,32
+ ,5
+ ,75
+ ,39
+ ,61
+ ,32
+ ,38
+ ,4
+ ,72
+ ,67
+ ,119
+ ,32
+ ,30
+ ,5
+ ,67
+ ,21
+ ,42
+ ,32
+ ,33
+ ,5
+ ,63
+ ,127
+ ,66
+ ,34
+ ,38
+ ,7
+ ,62
+ ,152
+ ,89
+ ,32
+ ,32
+ ,5
+ ,63
+ ,113
+ ,44
+ ,37
+ ,32
+ ,5
+ ,76
+ ,99
+ ,66
+ ,39
+ ,34
+ ,6
+ ,74
+ ,7
+ ,24
+ ,29
+ ,34
+ ,4
+ ,67
+ ,141
+ ,259
+ ,37
+ ,36
+ ,6
+ ,73
+ ,21
+ ,17
+ ,35
+ ,34
+ ,6
+ ,70
+ ,35
+ ,64
+ ,30
+ ,28
+ ,5
+ ,53
+ ,109
+ ,41
+ ,38
+ ,34
+ ,7
+ ,77
+ ,133
+ ,68
+ ,34
+ ,35
+ ,6
+ ,77
+ ,123
+ ,168
+ ,31
+ ,35
+ ,8
+ ,52
+ ,26
+ ,43
+ ,34
+ ,31
+ ,7
+ ,54
+ ,230
+ ,132
+ ,35
+ ,37
+ ,5
+ ,80
+ ,166
+ ,105
+ ,36
+ ,35
+ ,6
+ ,66
+ ,68
+ ,71
+ ,30
+ ,27
+ ,6
+ ,73
+ ,147
+ ,112
+ ,39
+ ,40
+ ,5
+ ,63
+ ,179
+ ,94
+ ,35
+ ,37
+ ,5
+ ,69
+ ,61
+ ,82
+ ,38
+ ,36
+ ,5
+ ,67
+ ,101
+ ,70
+ ,31
+ ,38
+ ,5
+ ,54
+ ,108
+ ,57
+ ,34
+ ,39
+ ,4
+ ,81
+ ,90
+ ,53
+ ,38
+ ,41
+ ,6
+ ,69
+ ,114
+ ,103
+ ,34
+ ,27
+ ,6
+ ,84
+ ,103
+ ,121
+ ,39
+ ,30
+ ,6
+ ,80
+ ,142
+ ,62
+ ,37
+ ,37
+ ,6
+ ,70
+ ,79
+ ,52
+ ,34
+ ,31
+ ,7
+ ,69
+ ,88
+ ,52
+ ,28
+ ,31
+ ,5
+ ,77
+ ,25
+ ,32
+ ,37
+ ,27
+ ,7
+ ,54
+ ,83
+ ,62
+ ,33
+ ,36
+ ,6
+ ,79
+ ,113
+ ,45
+ ,37
+ ,38
+ ,5
+ ,30
+ ,118
+ ,46
+ ,35
+ ,37
+ ,5
+ ,71
+ ,110
+ ,63
+ ,37
+ ,33
+ ,4
+ ,73
+ ,129
+ ,75
+ ,32
+ ,34
+ ,8
+ ,72
+ ,51
+ ,88
+ ,33
+ ,31
+ ,8
+ ,77
+ ,93
+ ,46
+ ,38
+ ,39
+ ,5
+ ,75
+ ,76
+ ,53
+ ,33
+ ,34
+ ,5
+ ,69
+ ,49
+ ,37
+ ,29
+ ,32
+ ,6
+ ,54
+ ,118
+ ,90
+ ,33
+ ,33
+ ,4
+ ,70
+ ,38
+ ,63
+ ,31
+ ,36
+ ,5
+ ,73
+ ,141
+ ,78
+ ,36
+ ,32
+ ,5
+ ,54
+ ,58
+ ,25
+ ,35
+ ,41
+ ,5
+ ,77
+ ,27
+ ,45
+ ,32
+ ,28
+ ,5
+ ,82
+ ,91
+ ,46
+ ,29
+ ,30
+ ,6
+ ,80
+ ,48
+ ,41
+ ,39
+ ,36
+ ,6
+ ,80
+ ,63
+ ,144
+ ,37
+ ,35
+ ,5
+ ,69
+ ,56
+ ,82
+ ,35
+ ,31
+ ,6
+ ,78
+ ,144
+ ,91
+ ,37
+ ,34
+ ,5
+ ,81
+ ,73
+ ,71
+ ,32
+ ,36
+ ,7
+ ,76
+ ,168
+ ,63
+ ,38
+ ,36
+ ,5
+ ,76
+ ,64
+ ,53
+ ,37
+ ,35
+ ,6
+ ,73
+ ,97
+ ,62
+ ,36
+ ,37
+ ,6
+ ,85
+ ,117
+ ,63
+ ,32
+ ,28
+ ,6
+ ,66
+ ,100
+ ,32
+ ,33
+ ,39
+ ,4
+ ,79
+ ,149
+ ,39
+ ,40
+ ,32
+ ,5
+ ,68
+ ,187
+ ,62
+ ,38
+ ,35
+ ,5
+ ,76
+ ,127
+ ,117
+ ,41
+ ,39
+ ,7
+ ,71
+ ,37
+ ,34
+ ,36
+ ,35
+ ,6
+ ,54
+ ,245
+ ,92
+ ,43
+ ,42
+ ,9
+ ,46
+ ,87
+ ,93
+ ,30
+ ,34
+ ,6
+ ,82
+ ,177
+ ,54
+ ,31
+ ,33
+ ,6
+ ,74
+ ,49
+ ,144
+ ,32
+ ,41
+ ,5
+ ,88
+ ,49
+ ,14
+ ,32
+ ,33
+ ,6
+ ,38
+ ,73
+ ,61
+ ,37
+ ,34
+ ,5
+ ,76
+ ,177
+ ,109
+ ,37
+ ,32
+ ,8
+ ,86
+ ,94
+ ,38
+ ,33
+ ,40
+ ,7
+ ,54
+ ,117
+ ,73
+ ,34
+ ,40
+ ,5
+ ,70
+ ,60
+ ,75
+ ,33
+ ,35
+ ,7
+ ,69
+ ,55
+ ,50
+ ,38
+ ,36
+ ,6
+ ,90
+ ,39
+ ,61
+ ,33
+ ,37
+ ,6
+ ,54
+ ,64
+ ,55
+ ,31
+ ,27
+ ,9
+ ,76
+ ,26
+ ,77
+ ,38
+ ,39
+ ,7
+ ,89
+ ,64
+ ,75
+ ,37
+ ,38
+ ,6
+ ,76
+ ,58
+ ,72
+ ,33
+ ,31
+ ,5
+ ,73
+ ,95
+ ,50
+ ,31
+ ,33
+ ,5
+ ,79
+ ,25
+ ,32
+ ,39
+ ,32
+ ,6
+ ,90
+ ,26
+ ,53
+ ,44
+ ,39
+ ,6
+ ,74
+ ,76
+ ,42
+ ,33
+ ,36
+ ,7
+ ,81
+ ,129
+ ,71
+ ,35
+ ,33
+ ,5
+ ,72
+ ,11
+ ,10
+ ,32
+ ,33
+ ,5
+ ,71
+ ,2
+ ,35
+ ,28
+ ,32
+ ,5
+ ,66
+ ,101
+ ,65
+ ,40
+ ,37
+ ,6
+ ,77
+ ,28
+ ,25
+ ,27
+ ,30
+ ,4
+ ,65
+ ,36
+ ,66
+ ,37
+ ,38
+ ,5
+ ,74
+ ,89
+ ,41
+ ,32
+ ,29
+ ,7
+ ,82
+ ,193
+ ,86
+ ,28
+ ,22
+ ,5
+ ,54
+ ,4
+ ,16
+ ,34
+ ,35
+ ,7
+ ,63
+ ,84
+ ,42
+ ,30
+ ,35
+ ,7
+ ,54
+ ,23
+ ,19
+ ,35
+ ,34
+ ,6
+ ,64
+ ,39
+ ,19
+ ,31
+ ,35
+ ,5
+ ,69
+ ,14
+ ,45
+ ,32
+ ,34
+ ,8
+ ,54
+ ,78
+ ,65
+ ,30
+ ,34
+ ,5
+ ,84
+ ,14
+ ,35
+ ,30
+ ,35
+ ,5
+ ,86
+ ,101
+ ,95
+ ,31
+ ,23
+ ,5
+ ,77
+ ,82
+ ,49
+ ,40
+ ,31
+ ,6
+ ,89
+ ,24
+ ,37
+ ,32
+ ,27
+ ,4
+ ,76
+ ,36
+ ,64
+ ,36
+ ,36
+ ,5
+ ,60
+ ,75
+ ,38
+ ,32
+ ,31
+ ,5
+ ,75
+ ,16
+ ,34
+ ,35
+ ,32
+ ,7
+ ,73
+ ,55
+ ,32
+ ,38
+ ,39
+ ,6
+ ,85
+ ,131
+ ,65
+ ,42
+ ,37
+ ,7
+ ,79
+ ,131
+ ,52
+ ,34
+ ,38
+ ,10
+ ,71
+ ,39
+ ,62
+ ,35
+ ,39
+ ,6
+ ,72
+ ,144
+ ,65
+ ,35
+ ,34
+ ,8
+ ,69
+ ,139
+ ,83
+ ,33
+ ,31
+ ,4
+ ,78
+ ,211
+ ,95
+ ,36
+ ,32
+ ,5
+ ,54
+ ,78
+ ,29
+ ,32
+ ,37
+ ,6
+ ,69
+ ,50
+ ,18
+ ,33
+ ,36
+ ,7
+ ,81
+ ,39
+ ,33
+ ,34
+ ,32
+ ,7
+ ,84
+ ,90
+ ,247
+ ,32
+ ,35
+ ,6
+ ,84
+ ,166
+ ,139
+ ,34
+ ,36
+ ,6
+ ,69
+ ,12
+ ,29)
+ ,dim=c(6
+ ,162)
+ ,dimnames=list(c('Connected'
+ ,'Separate'
+ ,'age'
+ ,'beloning'
+ ,'totblogs'
+ ,'Login')
+ ,1:162))
>  y <- array(NA,dim=c(6,162),dimnames=list(c('Connected','Separate','age','beloning','totblogs','Login'),1:162))
>  for (i in 1:dim(x)[1])
+  {
+  	for (j in 1:dim(x)[2])
+  	{
+  		y[i,j] <- as.numeric(x[i,j])
+  	}
+  }
> par1 = 'pearson'
> main = 'Correlation Matrix'
> par1 <- 'pearson'
> #'GNU S' R Code compiled by R2WASP v. 1.2.291 ()
> #Author: root
> #To cite this work: Patrick Wessa, (2012), Multivariate Correlation Matrix (v1.0.5) in Free Statistics Software (v$_version), Office for Research Development and Education, URL http://www.wessa.net/Patrick.Wessa/rwasp_pairs.wasp/
> #Source of accompanying publication: 
> #
> panel.tau <- function(x, y, digits=2, prefix='', cex.cor)
+ {
+ usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
+ par(usr = c(0, 1, 0, 1))
+ rr <- cor.test(x, y, method=par1)
+ r <- round(rr$p.value,2)
+ txt <- format(c(r, 0.123456789), digits=digits)[1]
+ txt <- paste(prefix, txt, sep='')
+ if(missing(cex.cor)) cex <- 0.5/strwidth(txt)
+ text(0.5, 0.5, txt, cex = cex)
+ }
> panel.hist <- function(x, ...)
+ {
+ usr <- par('usr'); on.exit(par(usr))
+ par(usr = c(usr[1:2], 0, 1.5) )
+ h <- hist(x, plot = FALSE)
+ breaks <- h$breaks; nB <- length(breaks)
+ y <- h$counts; y <- y/max(y)
+ rect(breaks[-nB], 0, breaks[-1], y, col='grey', ...)
+ }
> postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/190mr1354799309.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) 
> pairs(t(y),diag.panel=panel.hist, upper.panel=panel.smooth, lower.panel=panel.tau, main=main)
> dev.off()
null device 
          1 
> 
> #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab
> load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable")
> 
> n <- length(y[,1])
> n
[1] 6
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,paste('Correlations for all pairs of data series (method=',par1,')',sep=''),n+1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,' ',header=TRUE)
> for (i in 1:n) {
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE)
+ }
> a<-table.row.end(a)
> for (i in 1:n) {
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],header=TRUE)
+ for (j in 1:n) {
+ r <- cor.test(y[i,],y[j,],method=par1)
+ a<-table.element(a,round(r$estimate,3))
+ }
+ a<-table.row.end(a)
+ }
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2bff01354799309.tab") 
> a<-table.start()
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'Correlations for all pairs of data series with p-values',4,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> a<-table.row.start(a)
> a<-table.element(a,'pair',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Pearson r',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Spearman rho',1,TRUE)
> a<-table.element(a,'Kendall tau',1,TRUE)
> a<-table.row.end(a)
> cor.test(y[1,],y[2,],method=par1)

	Pearson's product-moment correlation

data:  y[1, ] and y[2, ] 
t = 5.0086, df = 160, p-value = 1.436e-06
alternative hypothesis: true correlation is not equal to 0 
95 percent confidence interval:
 0.2268369 0.4942909 
sample estimates:
      cor 
0.3681553 

> for (i in 1:(n-1))
+ {
+ for (j in (i+1):n)
+ {
+ a<-table.row.start(a)
+ dum <- paste(dimnames(t(x))[[2]][i],';',dimnames(t(x))[[2]][j],sep='')
+ a<-table.element(a,dum,header=TRUE)
+ rp <- cor.test(y[i,],y[j,],method='pearson')
+ a<-table.element(a,round(rp$estimate,4))
+ rs <- cor.test(y[i,],y[j,],method='spearman')
+ a<-table.element(a,round(rs$estimate,4))
+ rk <- cor.test(y[i,],y[j,],method='kendall')
+ a<-table.element(a,round(rk$estimate,4))
+ a<-table.row.end(a)
+ a<-table.row.start(a)
+ a<-table.element(a,'p-value',header=T)
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rp$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rs$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.element(a,paste('(',round(rk$p.value,4),')',sep=''))
+ a<-table.row.end(a)
+ }
+ }
There were 15 warnings (use warnings() to see them)
> a<-table.end(a)
> table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3eh2r1354799309.tab") 
> 
> try(system("convert tmp/190mr1354799309.ps tmp/190mr1354799309.png",intern=TRUE))
character(0)
> 
> 
> proc.time()
   user  system elapsed 
  1.529   0.211   1.724