R version 2.15.2 (2012-10-26) -- "Trick or Treat" Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit) R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(7 + ,1 + ,4 + ,5 + ,5 + ,3 + ,5 + ,4 + ,5 + ,4 + ,4 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,1 + ,4 + ,7 + ,5 + ,5 + ,6 + ,6 + ,3 + ,2 + ,4 + ,7 + ,6 + ,3 + ,3 + ,6 + ,7 + ,6 + ,5 + ,7 + ,6 + ,4 + ,2 + ,5 + ,5 + ,3 + ,3 + ,3 + ,3 + ,3 + ,3 + ,2 + ,7 + ,6 + ,7 + ,7 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,5 + ,4 + ,6 + ,7 + ,1 + ,6 + ,7 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,3 + ,4 + ,5 + ,7 + ,4 + ,6 + ,7 + ,4 + ,2 + ,3 + ,5 + ,7 + ,3 + ,2 + ,5 + ,7 + ,5 + ,5 + ,6 + ,7 + ,5 + ,5 + ,7 + ,7 + ,5 + ,5 + ,7 + ,3 + ,2 + ,1 + ,2 + ,7 + ,4 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,7 + ,6 + ,5 + ,7 + ,5 + ,4 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,7 + ,6 + ,4 + ,3 + ,4 + ,4 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,3 + ,6 + ,6 + ,7 + ,4 + ,7 + ,7 + ,5 + ,4 + ,2 + ,5 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,5 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,7 + ,6 + ,6 + ,7 + ,7 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,2 + ,4 + ,6 + ,4 + ,3 + ,2 + ,3 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,4 + ,4 + ,4 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,3 + ,3 + ,4 + ,3 + ,4 + ,3 + ,3 + ,7 + ,5 + ,7 + ,7 + ,6 + ,2 + ,4 + ,4 + ,6 + ,7 + ,4 + ,7 + ,5 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,1 + ,2 + ,4 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,2 + ,5 + ,7 + ,6 + ,5 + ,6 + ,5 + ,7 + ,5 + ,4 + ,4 + ,7 + ,6 + ,6 + ,7 + ,5 + ,5 + ,4 + ,4 + ,7 + ,4 + ,4 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,2 + ,4 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,4 + ,5 + ,5 + ,6 + ,2 + ,6 + ,6 + ,6 + ,2 + ,2 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,7 + ,6 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,5 + ,6 + ,6 + ,7 + ,5 + ,7 + ,7 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,5 + ,6 + ,7 + ,6 + ,3 + ,2 + ,2 + ,6 + ,4 + ,5 + ,5 + ,7 + ,3 + ,6 + ,6 + ,6 + ,4 + ,6 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,3 + ,1 + ,1 + ,1 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,4 + ,5 + ,5 + ,5 + ,3 + ,4 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,7 + ,6 + ,5 + ,3 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,7 + ,5 + ,5 + ,5 + ,6 + ,3 + ,6 + ,6 + ,6 + ,3 + ,4 + ,5 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,7 + ,5 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,3 + ,2 + ,5 + ,5 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,4 + ,6 + ,6 + ,6 + ,4 + ,4 + ,6 + ,4 + ,2 + ,4 + ,1 + ,6 + ,3 + ,6 + ,7 + ,7 + ,6 + ,7 + ,7 + ,7 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,3 + ,4 + ,5 + ,5 + ,5 + ,5 + ,7 + ,6 + ,5 + ,6 + ,3 + ,2 + ,2 + ,3 + ,7 + ,6 + ,7 + ,7 + ,5 + ,5 + ,5 + ,6 + ,7 + ,3 + ,5 + ,6 + ,5 + ,5 + ,2 + ,6 + ,3 + ,4 + ,3 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,5 + ,6 + ,6 + ,4 + ,4 + ,3 + ,3 + ,7 + ,7 + ,7 + ,7 + ,6 + ,2 + ,5 + ,5 + ,7 + ,6 + ,7 + ,6 + ,2 + ,6 + ,4 + ,5 + ,5 + ,4 + ,5 + ,5 + ,6 + ,4 + ,6 + ,6 + ,6 + ,3 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,2 + ,5 + ,3 + ,5 + ,6 + ,6 + ,3 + ,3 + ,7 + ,6 + ,6 + ,7 + ,4 + ,1 + ,3 + ,3 + ,7 + ,5 + ,7 + ,7 + ,7 + ,4 + ,5 + ,5 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,6 + ,2 + ,5 + ,4 + ,4 + ,7 + ,4 + ,5 + ,6 + ,7 + ,5 + ,7 + ,7 + ,5 + ,4 + ,3 + ,4 + ,5 + ,3 + ,6 + ,6 + ,6 + ,3 + ,4 + ,5 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,2 + ,4 + ,4 + ,6 + ,4 + ,4 + ,5 + ,6 + ,4 + ,5 + ,5 + ,5 + ,4 + ,5 + ,5 + ,6 + ,5 + ,6 + ,6 + ,7 + ,3 + ,7 + ,7 + ,7 + ,5 + ,6 + ,7 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,4 + ,5 + ,6 + ,6 + ,6 + ,6 + ,5 + ,7 + ,7 + ,6 + ,7 + ,6 + ,5 + ,5 + ,7 + ,5 + ,4 + ,3 + ,6 + ,5 + ,3 + ,4 + ,4 + ,5 + ,1 + ,5 + ,5) + ,dim=c(4 + ,162) + ,dimnames=list(c('Q1_7' + ,'Q1_14' + ,'Q1_21' + ,'Q1_28 ') + ,1:162)) > y <- array(NA,dim=c(4,162),dimnames=list(c('Q1_7','Q1_14','Q1_21','Q1_28 '),1:162)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par1 = 'grey' > ylab = 'value' > xlab = 'variables' > main = 'Notched Boxplots' > z <- as.data.frame(t(y)) > postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1x5z41355068833.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > (r<-boxplot(z ,xlab=xlab,ylab=ylab,main=main,notch=TRUE,col=par1)) $stats [,1] [,2] [,3] [,4] [1,] 2 1 1 4 [2,] 5 3 4 5 [3,] 6 5 5 6 [4,] 7 6 6 6 [5,] 7 7 7 7 $n [1] 162 162 162 162 $conf [,1] [,2] [,3] [,4] [1,] 5.751727 4.62759 4.751727 5.875863 [2,] 6.248273 5.37241 5.248273 6.124137 $out [1] 3 2 2 3 3 2 1 1 3 3 3 3 $group [1] 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 $names [1] "Q1_7" "Q1_14" "Q1_21" "Q1_28\r" Warning messages: 1: In bxp(list(stats = c(2, 5, 6, 7, 7, 1, 3, 5, 6, 7, 1, 4, 5, 6, : some notches went outside hinges ('box'): maybe set notch=FALSE 2: In axis(side = 1, at = 1:4, labels = c("Q1_7", "Q1_14", "Q1_21", : font width unknown for character 0xd 3: In axis(side = 1, at = 1:4, labels = c("Q1_7", "Q1_14", "Q1_21", : font width unknown for character 0xd > dev.off() null device 1 > > #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") > > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/overview.htm','Boxplot statistics','Boxplot overview'),6,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_whisker.htm','lower whisker','definition of lower whisker'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_hinge.htm','lower hinge','definition of lower hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/central_tendency.htm','median','definitions about measures of central tendency'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_hinge.htm','upper hinge','definition of upper hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_whisker.htm','upper whisker','definition of upper whisker'),1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + for (j in 1:5) + { + a<-table.element(a,r$stats[j,i]) + } + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2xl8n1355068833.tab") > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Boxplot Notches',4,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,'lower bound',1,TRUE) > a<-table.element(a,'median',1,TRUE) > a<-table.element(a,'upper bound',1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + a<-table.element(a,r$conf[1,i]) + a<-table.element(a,r$stats[3,i]) + a<-table.element(a,r$conf[2,i]) + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3er2b1355068833.tab") > > try(system("convert tmp/1x5z41355068833.ps tmp/1x5z41355068833.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 0.968 0.213 1.155