R version 2.15.2 (2012-10-26) -- "Trick or Treat" Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit) R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(30 + ,31 + ,122 + ,111 + ,34 + ,27 + ,114 + ,69 + ,36 + ,34 + ,140 + ,116 + ,37 + ,35 + ,143 + ,103 + ,30 + ,37 + ,122 + ,139 + ,35 + ,40 + ,127 + ,135 + ,30 + ,30 + ,113 + ,113 + ,31 + ,28 + ,118 + ,99 + ,37 + ,28 + ,161 + ,76 + ,32 + ,32 + ,134 + ,110 + ,30 + ,33 + ,96 + ,121 + ,30 + ,28 + ,104 + ,95 + ,35 + ,25 + ,135 + ,66 + ,30 + ,34 + ,110 + ,111 + ,32 + ,30 + ,128 + ,77 + ,35 + ,38 + ,142 + ,101 + ,30 + ,28 + ,117 + ,108 + ,29 + ,35 + ,94 + ,135 + ,35 + ,33 + ,135 + ,70 + ,30 + ,39 + ,121 + ,124 + ,31 + ,30 + ,103 + ,92 + ,31 + ,31 + ,118 + ,104 + ,31 + ,33 + ,127 + ,113 + ,30 + ,30 + ,116 + ,95 + ,31 + ,24 + ,129 + ,89 + ,30 + ,31 + ,115 + ,83 + ,34 + ,27 + ,135 + ,96 + ,34 + ,26 + ,133 + ,95 + ,31 + ,33 + ,113 + ,110 + ,30 + ,33 + ,111 + ,106 + ,23 + ,26 + ,92 + ,78 + ,30 + ,35 + ,118 + ,115 + ,32 + ,26 + ,134 + ,74 + ,30 + ,30 + ,106 + ,93 + ,36 + ,28 + ,137 + ,88 + ,28 + ,27 + ,100 + ,104 + ,29 + ,34 + ,102 + ,86 + ,36 + ,29 + ,134 + ,104 + ,34 + ,28 + ,130 + ,99 + ,37 + ,32 + ,144 + ,101 + ,30 + ,26 + ,120 + ,53 + ,30 + ,29 + ,91 + ,96 + ,27 + ,25 + ,100 + ,58 + ,32 + ,37 + ,134 + ,117 + ,39 + ,24 + ,161 + ,82 + ,31 + ,24 + ,128 + ,57 + ,31 + ,23 + ,124 + ,71 + ,30 + ,31 + ,115 + ,105 + ,30 + ,26 + ,123 + ,60 + ,29 + ,31 + ,117 + ,77 + ,29 + ,31 + ,111 + ,73 + ,35 + ,25 + ,146 + ,78 + ,27 + ,23 + ,101 + ,81 + ,33 + ,31 + ,131 + ,101 + ,30 + ,38 + ,122 + ,118 + ,19 + ,18 + ,78 + ,59 + ,36 + ,29 + ,120 + ,101 + ,30 + ,28 + ,115 + ,22 + ,37 + ,30 + ,142 + ,77 + ,30 + ,28 + ,94 + ,100 + ,29 + ,23 + ,114 + ,39 + ,33 + ,25 + ,108 + ,42 + ,30 + ,27 + ,119 + ,80 + ,30 + ,20 + ,117 + ,48 + ,26 + ,35 + ,86 + ,131 + ,36 + ,19 + ,138 + ,46 + ,30 + ,24 + ,119 + ,89 + ,30 + ,24 + ,117 + ,51 + ,32 + ,29 + ,117 + ,108 + ,21 + ,26 + ,76 + ,86 + ,31 + ,28 + ,119 + ,105 + ,30 + ,32 + ,119 + ,85 + ,33 + ,28 + ,124 + ,103 + ,29 + ,23 + ,116 + ,83 + ,35 + ,27 + ,118 + ,77 + ,43 + ,31 + ,102 + ,26 + ,30 + ,24 + ,116 + ,73 + ,31 + ,23 + ,103 + ,42 + ,31 + ,26 + ,117 + ,71 + ,30 + ,32 + ,108 + ,105 + ,30 + ,20 + ,122 + ,73 + ,35 + ,29 + ,90 + ,98 + ,36 + ,28 + ,133 + ,108 + ,33 + ,27 + ,116 + ,57 + ,31 + ,20 + ,110 + ,37 + ,28 + ,21 + ,90 + ,70 + ,32 + ,31 + ,74 + ,73 + ,20 + ,21 + ,75 + ,47 + ,30 + ,21 + ,107 + ,73 + ,27 + ,24 + ,90 + ,91 + ,30 + ,29 + ,96 + ,110 + ,29 + ,26 + ,115 + ,78 + ,29 + ,29 + ,91 + ,92 + ,22 + ,27 + ,77 + ,52 + ,30 + ,32 + ,108 + ,88 + ,30 + ,26 + ,83 + ,100 + ,26 + ,18 + ,77 + ,33 + ,28 + ,25 + ,99 + ,42 + ,30 + ,19 + ,115 + ,81 + ,30 + ,27 + ,99 + ,67 + ,31 + ,14 + ,106 + ,8 + ,25 + ,16 + ,77 + ,46 + ,30 + ,25 + ,115 + ,83 + ,19 + ,26 + ,67 + ,87 + ,2 + ,25 + ,8 + ,82 + ,32 + ,24 + ,69 + ,63 + ,24 + ,29 + ,88 + ,27 + ,31 + ,10 + ,107 + ,14 + ,30 + ,24 + ,120 + ,83 + ,4 + ,22 + ,3 + ,168 + ,1 + ,22 + ,1 + ,67 + ,4 + ,10 + ,0 + ,21 + ,0 + ,24 + ,0 + ,55 + ,0 + ,24 + ,0 + ,54 + ,NA + ,33 + ,NA + ,118 + ,NA + ,27 + ,NA + ,69 + ,NA + ,24 + ,NA + ,77 + ,NA + ,25 + ,NA + ,72 + ,NA + ,24 + ,NA + ,53 + ,NA + ,16 + ,NA + ,40 + ,NA + ,37 + ,NA + ,102 + ,NA + ,28 + ,NA + ,25 + ,NA + ,20 + ,NA + ,31 + ,NA + ,24 + ,NA + ,77 + ,NA + ,24 + ,NA + ,38 + ,NA + ,30 + ,NA + ,23 + ,NA + ,26 + ,NA + ,91 + ,NA + ,20 + ,NA + ,58 + ,NA + ,23 + ,NA + ,42 + ,NA + ,12 + ,NA + ,44 + ,NA + ,24 + ,NA + ,58 + ,NA + ,16 + ,NA + ,35 + ,NA + ,26 + ,NA + ,88 + ,NA + ,11 + ,NA + ,25 + ,NA + ,25 + ,NA + ,39 + ,NA + ,3 + ,NA + ,0 + ,NA + ,24 + ,NA + ,48 + ,NA + ,34 + ,NA + ,64 + ,NA + ,26 + ,NA + ,65 + ,NA + ,29 + ,NA + ,95 + ,NA + ,26 + ,NA + ,29 + ,NA + ,1 + ,NA + ,2 + ,NA + ,29 + ,NA + ,83 + ,NA + ,10 + ,NA + ,11 + ,NA + ,8 + ,NA + ,16 + ,NA + ,10 + ,NA + ,9 + ,NA + ,23 + ,NA + ,46 + ,NA + ,15 + ,NA + ,41 + ,NA + ,12 + ,NA + ,14 + ,NA + ,24 + ,NA + ,63 + ,NA + ,3 + ,NA + ,9 + ,NA + ,6 + ,NA + ,0 + ,NA + ,21 + ,NA + ,58 + ,NA + ,24 + ,NA + ,18 + ,NA + ,14 + ,NA + ,42 + ,NA + ,1 + ,NA + ,0 + ,NA + ,15 + ,NA + ,26 + ,NA + ,21 + ,NA + ,38 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,18 + ,NA + ,1 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,4 + ,NA + ,13 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0 + ,NA + ,0) + ,dim=c(4 + ,168) + ,dimnames=list(c('pr_UK' + ,'pr_B' + ,'lfm_UK' + ,'lfm_B') + ,1:168)) > y <- array(NA,dim=c(4,168),dimnames=list(c('pr_UK','pr_B','lfm_UK','lfm_B'),1:168)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par20 = '' > par19 = '' > par18 = '' > par17 = '' > par16 = '' > par15 = '' > par14 = '' > par13 = '' > par12 = '' > par11 = '' > par10 = '' > par9 = '' > par8 = '' > par7 = '' > par6 = '' > par5 = '' > par4 = '' > par3 = '' > par2 = '' > par1 = 'grey' > ylab = 'value' > xlab = 'variables' > main = 'Notched Boxplots' > z <- as.data.frame(t(y)) > postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1g3cu1358238084.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > (r<-boxplot(z ,xlab=xlab,ylab=ylab,main=main,notch=TRUE,col=par1)) $stats [,1] [,2] [,3] [,4] [1,] 25 10.0 67 0 [2,] 29 21.0 99 42 [3,] 30 26.0 115 73 [4,] 32 29.5 123 96 [5,] 36 40.0 146 168 $n [1] 114 168 114 168 $conf [,1] [,2] [,3] [,4] [1,] 29.55606 24.96385 111.4485 66.41742 [2,] 30.44394 27.03615 118.5515 79.58258 $out [1] 37 37 23 37 39 19 37 21 43 20 22 19 2 24 4 1 4 0 0 [20] 3 1 8 3 6 1 0 0 0 4 0 0 0 0 0 161 161 8 3 [39] 1 0 0 0 $group [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 [39] 3 3 3 3 $names [1] "pr_UK" "pr_B" "lfm_UK" "lfm_B" > dev.off() null device 1 > > #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") > > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/overview.htm','Boxplot statistics','Boxplot overview'),6,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_whisker.htm','lower whisker','definition of lower whisker'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_hinge.htm','lower hinge','definition of lower hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/central_tendency.htm','median','definitions about measures of central tendency'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_hinge.htm','upper hinge','definition of upper hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_whisker.htm','upper whisker','definition of upper whisker'),1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + for (j in 1:5) + { + a<-table.element(a,r$stats[j,i]) + } + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2nyqe1358238085.tab") > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Boxplot Notches',4,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,'lower bound',1,TRUE) > a<-table.element(a,'median',1,TRUE) > a<-table.element(a,'upper bound',1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + a<-table.element(a,r$conf[1,i]) + a<-table.element(a,r$stats[3,i]) + a<-table.element(a,r$conf[2,i]) + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3i8om1358238085.tab") > > try(system("convert tmp/1g3cu1358238084.ps tmp/1g3cu1358238084.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 0.975 0.140 1.100