R version 3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing" Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under certain conditions. Type 'license()' or 'licence()' for distribution details. R is a collaborative project with many contributors. Type 'contributors()' for more information and 'citation()' on how to cite R or R packages in publications. Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or 'help.start()' for an HTML browser interface to help. Type 'q()' to quit R. > x <- array(list(11 + ,NA + ,NA + ,19 + ,16 + ,NA + ,NA + ,24 + ,NA + ,15 + ,NA + ,17 + ,19 + ,NA + ,NA + ,19 + ,NA + ,28 + ,NA + ,26 + ,NA + ,15 + ,NA + ,26 + ,NA + ,16 + ,24 + ,NA + ,25 + ,NA + ,22 + ,NA + ,NA + ,15 + ,21 + ,NA + ,NA + ,22 + ,27 + ,NA + ,NA + ,26 + ,NA + ,26 + ,22 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,22 + ,NA + ,20 + ,NA + ,21 + ,20 + ,NA + ,NA + ,22 + ,21 + ,NA + ,8 + ,NA + ,22 + ,NA + ,NA + ,20 + ,NA + ,24 + ,NA + ,17 + ,NA + ,20 + ,23 + ,NA + ,NA + ,20 + ,NA + ,22 + ,19 + ,NA + ,NA + ,15 + ,NA + ,20 + ,NA + ,22 + ,NA + ,17 + ,NA + ,14 + ,24 + ,NA + ,NA + ,17 + ,NA + ,23 + ,25 + ,NA + ,NA + ,16 + ,NA + ,18 + ,NA + ,20 + ,NA + ,18 + ,NA + ,23 + ,NA + ,24 + ,NA + ,23 + ,13 + ,NA + ,NA + ,20 + ,20 + ,NA + ,NA + ,19 + ,NA + ,22 + ,22 + ,NA + ,15 + ,NA + ,NA + ,17 + ,19 + ,NA + ,NA + ,20 + ,22 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,21 + ,16 + ,NA + ,20 + ,NA + ,21 + ,NA + ,20 + ,NA + ,NA + ,23 + ,18 + ,NA + ,NA + ,22 + ,16 + ,NA + ,NA + ,17 + ,24 + ,NA + ,13 + ,NA + ,NA + ,19 + ,20 + ,NA + ,22 + ,NA + ,19 + ,NA + ,NA + ,21 + ,15 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,24 + ,22 + ,NA + ,20 + ,NA + ,21 + ,NA + ,NA + ,19 + ,NA + ,14 + ,NA + ,25 + ,11 + ,NA + ,NA + ,17 + ,22 + ,NA + ,NA + ,20 + ,NA + ,22 + ,NA + ,15 + ,NA + ,23 + ,NA + ,20 + ,22 + ,NA + ,NA + ,16 + ,NA + ,25 + ,NA + ,18 + ,19 + ,NA + ,25 + ,NA + ,21 + ,NA + ,22 + ,NA + ,21 + ,NA + ,22 + ,NA + ,NA + ,23 + ,NA + ,20 + ,NA + ,6 + ,NA + ,15 + ,NA + ,18 + ,24 + ,NA + ,NA + ,22 + ,NA + ,21 + ,23 + ,NA + ,NA + ,20 + ,20 + ,NA + ,18 + ,NA + ,NA + ,25 + ,NA + ,16 + ,NA + ,20 + ,NA + ,14 + ,NA + ,22 + ,NA + ,26 + ,NA + ,20 + ,NA + ,17 + ,22 + ,NA + ,NA + ,22 + ,NA + ,20 + ,NA + ,17 + ,NA + ,22 + ,NA + ,17 + ,NA + ,22 + ,21 + ,NA + ,NA + ,25 + ,NA + ,11 + ,NA + ,19 + ,NA + ,24 + ,NA + ,17 + ,22 + ,NA + ,17 + ,NA + ,NA + ,26 + ,20 + ,NA + ,19 + ,NA + ,NA + ,21 + ,24 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,19 + ,13 + ,NA + ,NA + ,24 + ,NA + ,28 + ,NA + ,27 + ,22 + ,NA + ,23 + ,NA + ,19 + ,NA + ,18 + ,NA + ,NA + ,23 + ,21 + ,NA + ,NA + ,22 + ,17 + ,NA + ,NA + ,15 + ,21 + ,NA + ,NA + ,20 + ,26 + ,NA + ,19 + ,NA + ,NA + ,28 + ,21 + ,NA + ,NA + ,19 + ,NA + ,22 + ,NA + ,21 + ,NA + ,20 + ,NA + ,19 + ,11 + ,NA + ,NA + ,17 + ,19 + ,NA + ,20 + ,NA + ,17 + ,NA + ,NA + ,21 + ,21 + ,NA + ,NA + ,12 + ,23 + ,NA + ,22 + ,NA + ,22 + ,NA + ,21 + ,NA + ,NA + ,20 + ,NA + ,18 + ,NA + ,21 + ,NA + ,24 + ,22 + ,NA + ,20 + ,NA + ,NA + ,17 + ,19 + ,NA + ,16 + ,NA + ,19 + ,NA + ,23 + ,NA + ,NA + ,8 + ,NA + ,22 + ,23 + ,NA + ,15 + ,NA + ,NA + ,17 + ,21 + ,NA + ,NA + ,25 + ,NA + ,18 + ,20 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,21 + ,NA + ,24 + ,22 + ,NA + ,22 + ,NA + ,23 + ,NA + ,NA + ,17 + ,NA + ,15 + ,NA + ,22 + ,NA + ,19 + ,18 + ,NA + ,21 + ,NA + ,20 + ,NA + ,NA + ,19 + ,NA + ,19 + ,16 + ,NA + ,18 + ,NA + ,23 + ,NA + ,NA + ,22 + ,NA + ,23 + ,20 + ,NA + ,24 + ,NA + ,25 + ,NA + ,NA + ,25 + ,NA + ,20 + ,NA + ,23 + ,NA + ,21 + ,23 + ,NA + ,NA + ,23 + ,NA + ,11 + ,NA + ,21 + ,27 + ,NA + ,19 + ,NA + ,NA + ,21 + ,16 + ,NA + ,NA + ,21 + ,NA + ,22 + ,16 + ,NA + ,NA + ,18 + ,23 + ,NA + ,NA + ,24 + ,NA + ,20 + ,20 + ,NA + ,NA + ,18 + ,4 + ,NA + ,NA + ,14 + ,22 + ,NA + ,NA + ,17 + ,23 + ,NA + ,20 + ,NA + ,NA + ,18 + ,NA + ,19 + ,20 + ,NA + ,NA + ,15 + ,NA + ,24 + ,21 + ,NA + ,NA + ,19 + ,19 + ,NA + ,27 + ,NA + ,NA + ,23 + ,NA + ,23 + ,20 + ,NA + ,NA + ,17 + ,21 + ,NA + ,23 + ,NA + ,NA + ,22 + ,16 + ,NA + ,20 + ,NA + ,NA + ,16) + ,dim=c(2 + ,279) + ,dimnames=list(c('IF1' + ,'IM1') + ,1:279)) > y <- array(NA,dim=c(2,279),dimnames=list(c('IF1','IM1'),1:279)) > for (i in 1:dim(x)[1]) + { + for (j in 1:dim(x)[2]) + { + y[i,j] <- as.numeric(x[i,j]) + } + } > par20 = '' > par19 = '' > par18 = '' > par17 = '' > par16 = '' > par15 = '' > par14 = '' > par13 = '' > par12 = '' > par11 = '' > par10 = '' > par9 = '' > par8 = '' > par7 = '' > par6 = '' > par5 = '' > par4 = '' > par3 = '' > par2 = '' > par1 = 'grey' > ylab = 'value' > xlab = 'variables' > main = 'Notched Boxplots' > par1 <- 'grey' > z <- as.data.frame(t(y)) > postscript(file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/1bylh1440862570.ps",horizontal=F,onefile=F,pagecentre=F,paper="special",width=8.3333333333333,height=5.5555555555556) > (r<-boxplot(z ,xlab=xlab,ylab=ylab,main=main,notch=TRUE,col=par1)) $stats [,1] [,2] [1,] 15 11.0 [2,] 19 17.5 [3,] 21 20.0 [4,] 22 22.0 [5,] 26 28.0 $n [1] 120 159 $conf [,1] [,2] [1,] 20.5673 19.43614 [2,] 21.4327 20.56386 $out [1] 11 27 8 13 13 11 13 11 27 4 27 6 8 $group [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 $names [1] "IF1" "IM1" > dev.off() null device 1 > > #Note: the /var/wessaorg/rcomp/createtable file can be downloaded at http://www.wessa.net/cretab > load(file="/var/wessaorg/rcomp/createtable") > > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/overview.htm','Boxplot statistics','Boxplot overview'),6,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_whisker.htm','lower whisker','definition of lower whisker'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/lower_hinge.htm','lower hinge','definition of lower hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/central_tendency.htm','median','definitions about measures of central tendency'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_hinge.htm','upper hinge','definition of upper hinge'),1,TRUE) > a<-table.element(a,hyperlink('http://www.xycoon.com/upper_whisker.htm','upper whisker','definition of upper whisker'),1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + for (j in 1:5) + { + a<-table.element(a,r$stats[j,i]) + } + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/2npw11440862570.tab") > a<-table.start() > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Boxplot Notches',4,TRUE) > a<-table.row.end(a) > a<-table.row.start(a) > a<-table.element(a,'Variable',1,TRUE) > a<-table.element(a,'lower bound',1,TRUE) > a<-table.element(a,'median',1,TRUE) > a<-table.element(a,'upper bound',1,TRUE) > a<-table.row.end(a) > for (i in 1:length(y[,1])) + { + a<-table.row.start(a) + a<-table.element(a,dimnames(t(x))[[2]][i],1,TRUE) + a<-table.element(a,r$conf[1,i]) + a<-table.element(a,r$stats[3,i]) + a<-table.element(a,r$conf[2,i]) + a<-table.row.end(a) + } > a<-table.end(a) > table.save(a,file="/var/wessaorg/rcomp/tmp/3xjmr1440862570.tab") > > try(system("convert tmp/1bylh1440862570.ps tmp/1bylh1440862570.png",intern=TRUE)) character(0) > > > proc.time() user system elapsed 0.669 0.119 0.785